MagVigen™ DNA 纯化和尺寸选择试剂盒介绍

MagVigen™ – DNA 纯化和大小选择试剂盒可以从各种粗样品材料（例如 NGS 文库、PCR 构建体）中简单快速地分离 DNA。它能够有效回收 DNA 并有效去除不需要的污染物（例如引物、未掺入的 dNTP 和盐）

使用 Cat# k61001-Easy 的 DNA 文库清理示例：MagVigen™ Easy DNA Cleanup & Size Selection Kit。

图 1.对于严重污染的 NGS DNA 文库样品（接头二聚体比率 224%），MagVigen™ Easy DNA 清理和尺寸选择试剂盒 (K61001-Easy) 的性能优于传统品牌产品。净化后，使用 MagVigen™（通过质量控制 (QC)）时文库中的接头二聚体含量低于 3%，而使用 AmPure XP 时则超过 6%（未通过 QC）。

图 2.对于严重污染的 NGS DNA 文库样品（接头二聚体比率 186%），MagVigen™ Easy DNA 清理和尺寸选择试剂盒 (K61001-Easy) 的性能优于传统品牌产品。清理后，文库上的接头二聚体减少至 2.3%。

图 3. MagVigen™ Easy DNA 清理和尺寸选择试剂盒 (K61001-Easy) 对于中等污染的 NGS DNA 文库样品（接头二聚体比率 68%）也效果更好。净化后，使用 MagVigen™ 时，文库中的接头二聚体含量为 0.45%，而使用 AmPure XP 时为 1.2%。

图 4. MagVigen™ Easy DNA 清理和大小选择试剂盒 (K61001-Easy) 对于日志污染 NGS DNA 文库样品（接头二聚体比率 20%）仍然效果更好。净化后，使用 MagVigen™ 检测不到接头二聚体，而使用 AmPure XP 则检测不到 0.6%。

MagVigen™ DNA 大小选择磁性纳米粒子和试剂盒经过优化，可捕获所需截断大小的 DNA：>50bp、>100bp、>150bp、>200bp、>300bp、>400bp、>500bp、>700bp。

图 5. MagVigen™ DNA 大小选择 捕获所需大小的 DNA 片段。成功捕获 >500bp、>400bp、>300bp、>200bp 的 DNA 梯输入。

图 6显示了 MagVigen™ 磁珠在三种不同缓冲液条件下对不同大小的 DNA 片段的捕获效率。成功捕获 >150bp、>75bp、>35bp 的 DNA 梯输入。

图 7.使用 MagVigen™ 珠进行的基于非杂交的 DNA 捕获可在多种温度条件下使用。

图 8.一个用例。客户要求 200bp 截止值和与 A 公司 XP 珠子相同的方案。我们可以将 MagVigen™ 视为 XP 的替代品： 1. 在相同的比率、相似的产量下，MagVigen™ 实现了更高的保真度。 XP捕获了很多100bp。 2. 从比率 0.8 可以看出，向后趋势（向上 0.8）MagVigen™ 具有更高的灵敏度。

MagVigen™ – Plasma DNA Capture

详细介绍

产品咨询

MagVigen™ – Plasma DNA Capture

产品内容

• MagVigen™ 血浆 DNA 捕获纳米颗粒

• 裂解缓冲液

• 蛋白酶K

• 蛋白酶 K 缓冲液

• 洗涤缓冲液 1 库存

• 洗脱缓冲液

所需材料

• 异丙醇

• 乙醇

• 十二烷基硫酸钠，20%

• 磁性架（NVIGEN Cat# A20006）

MagVigen™ 血浆 DNA 捕获试剂盒 (K61003) 能够从血浆和血清中捕获小的循环游离 DNA (>30bp)。

Protocols

1. 准备血浆样品：如果使用冷冻血浆，请在室温下解冻。将血浆以 12000x g 离心 5 分钟，以去除任何血液和细胞碎片。

2. 制备裂解缓冲液：如果有固体，则在 60°C 下加热几分钟以制成澄清溶液。

3. 制备蛋白酶溶液：将蛋白酶 K 缓冲液添加到蛋白酶 K 粉末瓶中。涡旋混合均匀。储存于-20°C。

4. 制备洗涤缓冲液 1：根据表 1 计算所需量。向每 550 ul 洗涤缓冲液 1 原液中添加 450 ul 异丙醇。每次都新鲜制作缓冲液。

5. 检查表1的总体积来决定使用的离心管类型（1.5ml、2ml、5ml、15ml或50ml）。

6. 将蛋白酶 K 溶液添加到样品管底部，将血浆添加到管中。涡旋 5 秒以充分混合，短暂离心。

7. 将 20% SDS 添加到管中。涡旋 5 秒以充分混合，短暂离心。

8. 将裂解缓冲液添加到管中。涡旋 1 分钟以充分混合。短暂地旋转下来。 60°C 孵育 30 分钟。

9. 添加 MagVigen™ 血浆 DNA 捕获纳米颗粒。轻轻摇动小瓶使其分散。然后加入异丙醇，涡旋混匀，短暂离心，继续涡旋 45 分钟。

10. 将反应管放在磁力架上沉淀珠子，直至溶液澄清（10-20 分钟，具体取决于磁铁的强度和样品体积）。

11. 慢慢除去上清液。小心不要带走任何珠子，尽可能多地除去溶液。将磁力架敲击固体表面，使残留溶液沉降到管底，除去所有上清液。

12. 将管从磁铁上取下，添加洗涤缓冲液 1。通过移液或涡旋混合。如果从较大的 15 或 50 ml 试管开始，请将溶液转移到 1.5 或 2 ml 试管中。短暂地旋转下来。将珠子放在磁力架上沉淀（约 10 分钟），除去上清液。将磁力架敲击表面。除去所有上清液。

13. 使用 75% 乙醇清洗珠粒。不需要全分散珠粒。管子可以通过磁力架保持在适当的位置。稍微向前和向后倾斜装有样品管的磁力架。然后短暂旋转，使盖子中没有溶液残留。将珠子放在磁力架上（约 3 分钟）并除去所有上清液。在固体表面上敲击磁力架，使上清液残留物沉降到管底部。除去所有上清液。

14. 使用 75% 乙醇再次清洗珠粒。将珠子沉淀（约 2-3 分钟）并除去所有上清液。

15. 将管子放在磁力架上，风干沉淀以蒸发所有乙醇。这需要 2-3 分钟。

16. 将所需量的洗脱缓冲液添加到珠子中，上下移液直至所有沉淀物全重新分散。将珠子分散在洗脱缓冲液中 3 分钟。

17. 短暂地旋转下来。然后将管子放在磁力架上 2-3 分钟。

18. 收集上清液，不要干扰磁珠沉淀。上清液含有提取的DNA。吸取 DNA 溶液进行下游实验时，将管子放在磁铁旁边。提取的 cfDNA 溶液如果不立即使用，可保存在 -20°C。

MagVigen™ – Plasma DNA Capture

nvigen：MagVigen™ Easy DNA Select Kit

详细介绍

产品咨询

nvigen：MagVigen™ Easy DNA Select Kit

MagVigen™ DNA Select 纳米颗粒是 DNA 纯化的理想选择。 MagVigen™ DNA Select 纳米粒子能够有效回收双链和单链 DNA。经过短暂孵育后，MagVigen™ DNA Select 纳米粒子捕获 DNA 产物。生成的纳米颗粒-寡核苷酸复合物可以通过磁铁与样品的其余部分分离。可以使用洗脱缓冲液从纳米颗粒上洗脱保留的基因组材料。

MagVigen™ DNA Select 纳米颗粒能够从检测样品（例如细胞裂解液）中纯化 DNA 产品，使其不含盐和其他污染物。纯化的 DNA 产物可通过凝胶电泳、PCR 定量和测序进行进一步分析。

DNA 选择用于捕获的纳米颗粒。如果 DNA 数量或样品体积增加，则相应放大。

产品内容：

• MagVigen DNA 尺寸选择纳米粒子

• 洗脱液：Tris (PH 8)

所需材料（不含）

• 75%乙醇

• 磁力架，目录号 A20006

所有材料均应储存在 4°C 下。保质期：6个月

DNA捕获

1. 从储存中取出 MagVigen™ DNA Select 纳米颗粒溶液，并将其恢复至室温。

2. 使用前涡旋 MagVigen™ DNA 选择纳米颗粒 10 秒。

3. 对于每20μl 含有不超过 1,000ng DNA 的 DNA 样品，添加40~9 μl 体积的 Easy DNA Select 珠子。

注： MagVigen 纳米粒子的体积比为 (A)2.0:1 至 (B)0.7:1：DNA 样品可用于分离 ≥ (A)100bp 至 (B)400 bp 的 DNA，可以测试不同的比例以达到所需的 DNA 大小选择。

4. 涡旋或移液器吸取反应溶液以充分混合

注意： 捕获反应期间最好不要引入气泡。

5. 将 MagVigen™ DNA Select 纳米颗粒-DNA 反应在室温下孵育5~15 分钟。

6. 孵育后，使用磁铁将 DNA 捕获的纳米颗粒从溶液中分离出来。

7. 用移液器小心地除去上清液，注意不要扰动捕获 DNA 的纳米颗粒沉淀。

8. 将磁铁保持在适当的位置，通过添加 100μl 新鲜制备的 75% 乙醇来清洗 DNA 捕获的纳米颗粒沉淀。静置 3 分钟。

注意： 根据需要调整乙醇的体积，以充分覆盖 DNA 捕获的纳米颗粒颗粒。

9. 取出并丢弃乙醇溶液。

10. 重复步骤8~9，总共进行两次洗涤。

11. 将珠子风干 2~10 分钟。

12. 添加 20μl 洗脱缓冲液，从纳米颗粒中洗脱捕获的 DNA。

注： 洗脱缓冲液的体积可根据需要调整。

13. 轻轻吹打混匀，室温孵育 5 分钟。

注意：洗脱反应过程中最好不要引入气泡。

14. 用磁铁将纳米颗粒与洗脱的 DNA 分离。

15. 将含有 DNA 产物的上清液转移至干净的管中。纯化的 DNA 可用于下游应用。

    DNA 大小切割	100bp	200bp	300bp	400bp	500bp
    比率	>1.8~2.2	1.0~1.6	0.8~0.9	0.7	0.6或<0.6

    表 1. MagVigen™ 溶液与 DNA 样品溶液的比例的一般指导，以实现所需的 DNA 大小截断（100 bp~500 bp）。人们可以滴定不同的比例来确定最佳条件。

    

图 1显示了通过调整珠子体积与 DNA 样品体积的比率得到的大小结果。使用 Themo Scientific GeneRuler 100 bp DNAladder 和 2% 琼脂糖凝胶。

nvigen：MagVigen™ Easy DNA Select Kit