HR2-807| 日本DOJINDO

发表于2024年1月19日由上海金畔生物科技有限公司

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Products > Optimize Reagents > Optimize – Salts > Sodium malonate

Sodium malonate

CAT NO

HR2-747

NAME

3.4 M Sodium malonate pH 4.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$107.00

CAT NO

HR2-749

NAME

3.4 M Sodium malonate pH 5.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$107.00

CAT NO

HR2-751

NAME

3.4 M Sodium malonate pH 6.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$107.00

CAT NO

HR2-707

NAME

3.4 M Sodium malonate pH 7.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$107.00

CAT NO

HR2-807

NAME

3.4 M Sodium malonate pH 8.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$107.00

支持材料

HR2-747 Sodium malonate pH 4.0 SDS

HR2-749 Sodium malonate pH 5.0 SDS

HR2-751 Sodium malonate pH 6.0 SDS

HR2-707 Sodium malonate pH 7.0 SDS

HR2-807 Sodium malonate pH 8.0 SDS

pH/Dilution Table for Sodium Malonate

应用

Crystallization grade Sodium malonate for formulating screens or for optimization
用于配制筛选或优化的结晶级丙二酸钠

特征

Sterile filtered solution
Formulated in Type 1+ ultrapure water: 18.2 megaohm-cm resistivity at 25°C, < 5 ppb Total Organic Carbon, bacteria free (<1 Bacteria (CFU/ml)), pyrogen free (<0.03 Endotoxin (EU/ml)), RNase-free (< 0.01 ng/mL) and DNase-free (< 4 pg/µL)
无菌过滤溶液
在 1+ 型超纯水中配制：25°C 时电阻率为 18.2 兆欧厘米，总有机碳 < 5 ppb，无细菌（<1 细菌 (CFU/ml)），无热原（<0.03 内毒素 (EU/ml)） , 无 RNase (< 0.01 ng/mL) 和无 DNase (< 4 pg/µL)

描述

The Sodium malonate offered by Hampton Research is Malonic acid (CAS Number 141-82-2) titrated to pH 4.0-8.0 using Sodium hydroxide as described in the publication “A comparison of salts for the crystallization of macromolecules. Alexander McPherson. Protein Science (2001), 10:418-422.”. In this same publication, Sodium malonate was reported to be more successful than any other salt, resulting in the crystallization of 19 of the 23 macromolecules, almost twice as effective as the next most successful salt, which was a draw between sodium acetate, sodium tartrate, sodium formate, and ammonium sulfate. The high success rate of Sodium malonate in producing crystals was even more impressive when an overall unique success rate with individual macromolecules was considered.

The use of Sodium malonate in place of Ammonium sulfate has been reported in one instance to improve the reproducibility of crystals and improve resistance to physicochemical shocks. Sodium malonate also acted as a good cryoprotectant (Xing and Xu 2003).

One may combine the four different sodium malonate stocks to create a pH versus sodium malonate concentration grid for screening or optimization. Refer to the pH/Dilution Table for Sodium malonate.

Based on the structure of malonic acid titrated with sodium hydroxide, there are no chiral carbons so it is not characterized as having enantiomeric structures, such as D or L.

Hampton Research 提供的丙二酸钠是使用氢氧化钠滴定至 pH 4.0-8.0 的丙二酸（CAS 编号 141-82-2），如出版物“用于大分子结晶的盐的比较。Alexander McPherson。蛋白质科学（ 2001), 10:418-422”。在同一份出版物中，据报道丙二酸钠比任何其他盐更成功，导致 23 种大分子中的 19 种结晶，几乎是下一个最成功的盐的两倍，后者是乙酸钠和酒石酸钠之间的抽吸、甲酸钠和硫酸铵。当考虑到单个大分子的整体独特成功率时，丙二酸钠在生产晶体中的高成功率更加令人印象深刻。

据报道，在一个实例中使用丙二酸钠代替硫酸铵可提高晶体的再现性并提高对物理化学冲击的抵抗力。丙二酸钠也是一种很好的冷冻保护剂（Xing and Xu 2003）。

可以将四种不同的丙二酸钠库存组合起来，以创建一个 pH 值与丙二酸钠浓度网格，以进行筛选或优化。请参阅丙二酸钠的 pH/稀释表。

根据用氢氧化钠滴定的丙二酸的结构，没有手性碳，因此不具有对映异构体结构的特征，例如 D 或 L。

Synonyms: Propanedioic acid or Malonic acid
C₃H₄O₄ (before titration with NaOH)
M_r 104.06 (before titration with NaOH)
CAS Number 141-82-2
EC Number 205-503-0
Beilstein Registry Number 1751370
Merck 14,5710
RTECS OO0175000
MDL Number MFCD00002707
Purity > 99.0%
pKa1 2.8
pKa2 5.7

HR2-747 Measured Conductivity Range: 73.3 – 75.3 mS/cm at 25°C
HR2-747 Measured Refractive Index Range: 1.38365 – 1.38425 at 20°C

HR2-749 Measured Conductivity Range: 77.2 – 78.0 mS/cm at 25°C
HR2-749 Measured Refractive Index Range: 1.39264 – 1.39300 at 20°C

HR2-751 Measured Conductivity Range: 73.4 – 75.2 mS/cm at 25°C
HR2-751 Measured Refractive Index Range: 1.39938 – 1.39973 at 20°C

HR2-707 Measured Conductivity Range: 71.0 – 73.7 mS/cm at 25°C
HR2-707 Measured Refractive Index Range: 1.40090 – 1.40098 at 20°C

HR2-807 Measured Conductivity Range: 71.8 – 75.0 mS/cm at 25°C
HR2-807 Measured Refractive Index Range: 1.40106 – 1.40115 at 20°C

参考Sodium malonate

1. A comparison of salts for the crystallization of macromolecules. Alexander McPherson. Protein Science (2001), 10:418-422.

2. Crystallization of the PX domain of cytokine-independent survival kinase (CISK): improvement of crystal quality for X-ray diffraction with sodium malonate. Yi Xing and Wenqing Xu. Acta Cryst. (2003). D59, 1816-1818.

3. Malonate: a versatile cryoprotectant and stabilizing solution for salt-grown macromolecular crystals. T. Holyoak, T. D. Fenn, M. A. Wilson, A. G. Moulin, D. Ringe and G. A. Petsko. Acta Cryst. (2003). D59, 2356-2358.

4. Purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of Est25: a ketoprofen-specific hormone-sensitive lipase. Kim et al Acta Cryst. (2007). F63, 579–581.

1. 大分子结晶盐的比较。亚历山大·麦克弗森。蛋白质科学（2001），10：418-422。

2. 不依赖细胞因子的存活激酶 (CISK) 的 PX 结构域的结晶：用丙二酸钠改善 X 射线衍射的晶体质量。艺兴和徐文清。晶体学报。（2003 年）。 D59，1816-1818。

3. 丙二酸盐：一种用于盐生大分子晶体的多功能冷冻保护剂和稳定剂。 T. Holyoak、T. D. Fenn、M. A. Wilson、A. G. Moulin、D. Ringe 和 G. A. Petsko。晶体学报。（2003 年）。 D59，2356-2358。

4. Est25 的纯化、结晶和初步晶体学分析：一种酮洛芬特异性激素敏感性脂肪酶。 Kim等人Acta Cryst。（2007 年）。 F63, 579–581。

同仁化学Hampton蛋白结晶试剂盒Tacsimate pH4&5&6&7&8&9/HR2-823/HR2-755/HR2-829/HR2-813| 日本DOJINDO

发表于2024年1月16日由上海金畔生物科技有限公司

上海金畔社生物科技有限公司日本同仁化学dojindo全线产品代理中国代理商

Products > Optimize Reagents > Optimize – Salts > Tacsimate pH 4, 5, 6, 7, 8, & 9

Tacsimate pH 4, 5, 6, 7, 8, & 9

CAT NO

HR2-823

NAME

100% Tacsimate pH 4.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$120.00

CAT NO

HR2-825

NAME

100% Tacsimate pH 5.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$120.00

CAT NO

HR2-827

NAME

100% Tacsimate pH 6.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$120.00

CAT NO

HR2-755

NAME

100% Tacsimate pH 7.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$120.00

CAT NO

HR2-829

NAME

100% Tacsimate pH 8.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$120.00

CAT NO

HR2-813

NAME

100% Tacsimate pH 9.0

DESCRIPTION

200 mL

PRICE

$120.00

支持材料

What is Tacsimate?

Mixing Tacsimate Stocks to Screen Ph

HR2-823 Tacsimate 100% solution pH 4.0 SDS

HR2-825 Tacsimate 100% solution pH 5.0 SDS

HR2-827 Tacsimate 100% solution pH 6.0 SDS

HR2-755 Tacsimate 100% solution pH 7.0 SDS

HR2-829 Tacsimate 100% solution pH 8.0 SDS

HR2-813 Tacsimate 100% solution pH 9.0 SDS

应用

Crystallization grade Tacsimate for formulating screens or for optimization
结晶级 Tacsimate 用于配制屏幕或优化

特征

Sterile filtered solution
Formulated in Type 1+ ultrapure water: 18.2 megaohm-cm resistivity at 25°C, < 5 ppb Total Organic Carbon, bacteria free (<1 Bacteria (CFU/ml)), pyrogen free (<0.03 Endotoxin (EU/ml)), RNase-free (< 0.01 ng/mL) and DNase-free (< 4 pg/µL)
无菌过滤溶液
在 1+ 型超纯水中配制：25°C 时电阻率为 18.2 兆欧厘米，总有机碳 < 5 ppb，无细菌（<1 细菌 (CFU/ml)），无热原（<0.03 内毒素 (EU/ml)） , 无 RNase (< 0.01 ng/mL) 和无 DNase (< 4 pg/µL)

描述

To screen pH as a crystallization variable using Tacsimate one can mix together different ratios of different pH Tacsimate solutions. Refer to the pdf “Mixing Tacsimate Stocks to Screen pH” on this page. Or, one can add a buffer to the crystallizaiton reagent containing Tacsimate. Recommended final buffer concentration in the reagent well is 0.05 to 0.1 M.

Tacsimate
A pH titrated mixture of organic acids. 1.8305 M Malonic acid, 0.25 M Ammonium citrate tribasic, 0.12 M Succinic acid, 0.3 M DL-Malic acid, 0.4 M Sodium acetate trihydrate, 0.5 M Sodium formate, 0.16 M Ammonium tartrate dibasic. pH adjusted using NaOH

Measured pH of 100% Tacsimate is 4.0 at 25°C
Measured pH of 100% Tacsimate is 5.0 at 25°C
Measured pH of 100% Tacsimate is 6.0 at 25°C
Measured pH of 100% Tacsimate is 7.0 at 25°C
Measured pH of 100% Tacsimate is 8.0 at 25°C
Measured pH of 100% Tacsimate is 9.0 at 25°C

为了使用 Tacsimate 将 pH 值筛选为结晶变量，可以将不同比例的不同 pH 值的 Tacsimate 溶液混合在一起。请参阅本页上的 pdf“混合 Tacsimate 库存以筛选 pH 值”。或者，可以将缓冲液添加到含有 Tacsimate 的结晶试剂中。试剂孔中推荐的最终缓冲液浓度为 0.05 至 0.1 M。

战术
pH 值滴定的有机酸混合物。 1.8305 M 丙二酸、0.25 M 柠檬酸三铵、0.12 M 琥珀酸、0.3 M DL-苹果酸、0.4 M 三水乙酸钠、0.5 M 甲酸钠、0.16 M 酒石酸氢铵。使用 NaOH 调节 pH

在 25°C 时测得的 100% Tacsimate 的 pH 值为 4.0
在 25°C 时测得的 100% Tacsimate 的 pH 值为 5.0
在 25°C 时测得的 100% Tacsimate 的 pH 值为 6.0
在 25°C 时测得的 100% Tacsimate 的 pH 值为 7.0
在 25°C 时测得的 100% Tacsimate 的 pH 值为 8.0
在 25°C 时测得的 100% Tacsimate 的 pH 值为 9.0

Mixture of organic acids. Malonic acid, Ammonium citrate tribasic, Succinic acid, DL-Malic acid, Sodium acetate trihydrate, Sodium formate, and Ammonium tartrate dibasic

有机酸的混合物。丙二酸、柠檬酸三铵、琥珀酸、DL-苹果酸、醋酸钠三水合物、甲酸钠和酒石酸氢铵

参考

1. Searching for silver bullets: An alternative strategy for crystallizing macromolecules. Alexander McPherson and Bob Cudney. Journal of Structural Biology 156 (2006) 387–406.

2. A novel strategy for the crystallization of proteins: X-ray diffraction validation. Steven B. Larson, John S. Day, Robert Cudney and Alexander McPherson. Acta Cryst. (2007). D63, 310–318.

3. Structure of the catalytic and ubiquitin-associated domains of the protein kinase MARK/Par-1. Eckhard Mandelkow et al. Structure 14, 173-183, February 2006.

4. A comparison of salts for the crystallization of macromolecules. Alexander McPherson. Protein Science (2001), 10:418-422.

5. Crystallization of a newly discovered histidine acid phosphatase from Francisella tularensis. Richard L. Felts, Thomas J. Reilly, Michael J. Calcutt, and John J. Tanner. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun. 2006 January 1; 62(Pt 1): 32–35.

6. Structure of the GTPase and GDI domains of FeoB, the ferrous iron transporter of Legionella pneumophila. Petermann et al, FEBS Letters Volume 584, Issue 4, Pages 733-738 (19 February 2010).

1. 寻找灵丹妙药：结晶大分子的另一种策略。亚历山大·麦克弗森和鲍勃·库德尼。结构生物学杂志 156 (2006) 387–406。

2. 蛋白质结晶的新策略：X 射线衍射验证。 Steven B. Larson、John S. Day、Robert Cudney 和 Alexander McPherson。晶体学报。（2007 年）。 D63，310-318。

3. 蛋白激酶 MARK/Par-1 的催化和泛素相关结构域的结构。 Eckhard Mandelkow 等人。结构 14, 173-183，2006 年 2 月。

4. 大分子结晶盐的比较。亚历山大·麦克弗森。蛋白质科学（2001），10：418-422。

5. 从土拉弗朗西斯菌中新发现的组氨酸酸性磷酸酶的结晶。 Richard L. Felts、Thomas J. Reilly、Michael J. Calcutt 和 John J. Tanner。 Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun。 2006 年 1 月 1 日； 62（第 1 篇）：32-35。

6. 嗜肺军团菌的亚铁转运体 FeoB 的 GTPase 和 GDI 结构域。 Petermann 等人，FEBS Letters 第 584 卷，第 4 期，第 733-738 页（2010 年 2 月 19 日）。

同仁化学Hampton蛋白结晶试剂盒Tryptone/HR2-835| 日本DOJINDO

发表于2024年1月15日由上海金畔生物科技有限公司

上海金畔社生物科技有限公司日本同仁化学dojindo全线产品代理中国代理商

Products > Optimize Reagents > Optimize – Salts > Tryptone

Tryptone

CAT NO

HR2-835

NAME

10% w/v Tryptone

DESCRIPTION

100 mL

PRICE

$94.00

支持材料

HR2-835 10% w/v Tryptone SDS

应用

Crystallization grade Tryptone for formulating screens or for optimization
用于配制筛选或优化的结晶级胰蛋白胨

特征

Sterile filtered solution
Formulated in Type 1+ ultrapure water: 18.2 megaohm-cm resistivity at 25°C, < 5 ppb Total Organic Carbon, bacteria free (<1 Bacteria (CFU/ml)), pyrogen free (<0.03 Endotoxin (EU/ml)), RNase-free (< 0.01 ng/mL) and DNase-free (< 4 pg/µL)
无菌过滤溶液
在 1+ 型超纯水中配制：25°C 时电阻率为 18.2 兆欧厘米，总有机碳 < 5 ppb，无细菌（<1 细菌 (CFU/ml)），无热原（<0.03 内毒素 (EU/ml)） , 无 RNase (< 0.01 ng/mL) 和无 DNase (< 4 pg/µL)

描述Tryptone

Synonyms: Peptone from casein
Microbiologically tested
CAS Number [91079-40-2]
EC Number: 293-428-4

Measured pH Range: 6.9 – 7.1 at 25°C
Measured Conductivity Range: 7.5 – 11.1 mS/cm at 25°C
Measured Refractive Index Range: 1.35040 – 1.35133 at 20°C

Tryptone is the assortment of peptides formed by the digestion of casein by the protease trypsin. Tryptone is rich in tryptophan. There are no detectable levels of carbohydrates in Tryptone. The enzymatic digest is pasteurized and spray dried prior to formulation in Type 1 laboratory water and sterile filtered (0.22 micron filter).

同义词：酪蛋白蛋白胨
微生物测试
CAS 编号 [91079-40-2]
欧盟编号：293-428-4

测得的 pH 值范围：25°C 时为 6.9 – 7.1
测得的电导率范围：25°C 时 7.5 – 11.1 mS/cm
测得的折射率范围：20°C 时为 1.35040 – 1.35133

胰蛋白胨是由蛋白酶胰蛋白酶消化酪蛋白形成的肽组合。色氨酸富含色氨酸。胰蛋白胨中没有可检测到的碳水化合物水平。酶消化物经过巴氏杀菌和喷雾干燥，然后在 1 型实验室用水中进行配制并无菌过滤（0.22 微米过滤器）。

参考Tryptone

1. Progress in the Development of an Alternative Approach to Macromolecular Crystallization. S. B. Larson,J. S. Day, C. Nguyen, R. Cudney, and A. McPherson. Crystal Growth & Design 2008 Volume 8, No. 8 3038-3052.

1. 大分子结晶替代方法的开发进展。 S. B.拉尔森，J. S. Day、C. Nguyen、R. Cudney 和 A. McPherson。晶体生长与设计 2008 年第 8 卷，第 8 期 3038-3052。

同仁化学Hampton蛋白结晶试剂盒Glycerol/HR2-623| 日本DOJINDO

发表于2023年12月28日由上海金畔生物科技有限公司

上海金畔社生物科技有限公司日本同仁化学dojindo全线产品代理中国代理商

Products > Optimize Reagents > Optimize – Organics (Non-Volatile) > Glycerol

Glycerol

CAT NO

HR2-623

NAME

100% Glycerol

DESCRIPTION

100 mL

PRICE

$84.00

支持材料

HR2-623 Glycerol SDS

应用

Crystallization grade Glycerol for formulating screens, optimization and cryoprotection
结晶级甘油，用于配制筛选、优化和冷冻保护

特征

Gradually increasing the Glycerol concentration to 5 to 35% in the original crystallization reagent is often times an effective cryoprotectant.
将原始结晶试剂中的甘油浓度逐渐增加到 5% 到 35% 通常是一种有效的冷冻保护剂。

描述Glycerol

Synonyms: 1,2,3-Propanetriol or Glycerin
HOCH₂CH(OH)CH₂OH
C₃H₈O₃
M_r 92.09
CAS Number [56-81-5]
EC Number 200-289-5
Beilstein Registry Number 635685
RTECS MA8050000
MDL Number MFCD00004722
PubChem Substance ID 24895252
Purity ≥ 99.0% (GC)
pKa 14.2

Measured pH range of 100% Glycerol: 5.0 – 7.7 at 25°C
Measured Conductivity Range: 0.0 – 0.2 µS/cm at 25°C
Measured Refractive Index Range: 1.47124 – 1.47450 at 20°C

同义词：1,2,3-丙三醇或甘油
HOCH2CH(OH)CH2OH
C3H8O3
92.09 先生
CAS 编号 [56-81-5]
欧盟编号 200-289-5
贝尔斯坦注册号 635685
RTECS MA8050000
MDL 编号 MFCD00004722
PubChem 物质 ID 24895252
纯度 ≥ 99.0% (GC)
pKa 14.2

测得的 100% 甘油的 pH 值范围：25°C 时为 5.0 – 7.7
测量电导率范围：25°C 时 0.0 – 0.2 µS/cm
测得的折射率范围：20°C 时为 1.47124 – 1.47450

Al ≤0.0005%
Ca ≤0.0005%
Cd ≤0.0001%
Cl ≤0.001%
Cu ≤0.0005%
Fe ≤0.0005%
K ≤0.005%
Mg ≤0.0005%
NH₃ ≤0.05%
NH₄⁺ ≤0.05%
Na ≤0.005%
P ≤0.0005%
Pb ≤0.001%
SO₄ ≤0.002%
Zn ≤0.0005%

参考Glycerol

1. Crystallization and Preliminary X-ray Analysis of the Auto-inhibited Twitchin Kinase. Hu, S-H; Lei, JY; Wilce, MCJ; Valenzuela, MRL; Benian, GM; Parker, MW; Kemp, BE. J Mol Biol 236, 1259- 1261, 1994.

1. 自抑制 Twitchin 激酶的结晶和初步 X 射线分析。胡，S-H；雷，JY；威尔斯，MCJ；瓦伦苏埃拉，MRL；贝尼安，总经理；帕克，兆瓦；坎普，BE。分子生物学杂志 236, 1259-1261, 1994。

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