xGen™ cfDNA & FFPE DNA 文库制备试剂盒产品详情
应用
xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备机械剪切试剂盒 v2 可制备适用于使用降解样本的多类研究应用的二代测序 (NGS) 文库，这些应用包括：
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低频体细胞变异 SNP 识别
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插入/缺失 (insertions/deletion, indel)
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识别遗传种系 SNP 和 indel
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全基因组测序 (WGS)
xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备实验方案需要大约 4 个小时，仅包括四个主要步骤，充分减少了样本处理操作（图 1）：
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末端修复。 末端修复酶混合物将 cfDNA 或剪切过的起始 DNA（如 FFPE DNA）转化为可用于连接的平末端 DNA。
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连接 1。 在连接 1 酶的催化作用下，将连接 1 接头单链添加到剪切 DNA 片段的 3' 端。这种新型酶不能将插入片段连接起来，可充分减少嵌合体的形成。连接 1 接头的 3' 端还含有一个封闭基团，以防止形成接头二聚体。
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连接 2。 连接 2 接头充当引物，与连接 1 接头互补，填充碱基间隙，然后连接到 DNA 插入片段的 5′ 端，以形成双链产物。
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PCR 扩增。 包含 xGen 2x HiFi PCR 混合液，用于执行加标签 PCR（引物单独出售），以便于进行 Illumina® 测序。
图 1. xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备 v2 机械剪切试剂盒工作流程。 在第一步中，末端修复酶将 cfDNA 或剪切过的起始 DNA 转化为可用于连接的平末端 DNA。然后，在连接 1 酶的催化作用下，将连接 1 接头单链添加到 DNA 插入片段的 3′ 端。这种新型酶不能将插入片段连接起来，可充分减少嵌合体的形成。连接 1 接头的 3' 端还含有一个封闭基团，以防止形成接头二聚体。连接 2 接头充当引物，与连接 1 接头互补，填充碱基间隙，然后连接到 DNA 插入片段的 5′ 端，形成双链产物。在最后一步中，通过 IDT 2x HiFi PCR 混合液进行 PCR，在片段上加上样本标签序列，以便在 Illumina® 平台上测序。
技术详情
xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备 v2 机械剪切试剂盒包括末端修复、连接 1 和连接 2 反应以及 PCR 所需的所有试剂。
表 1. 规格参数、更多试剂和设备。
| 功能 | 详情 |
|---|---|
| 样本类型 | 高品质 DNA、cfDNA、来自 FFPE 样本的 DNA |
| 起始量范围 | 1–250 ng |
| 接头 | 包含 |
| 标签引物（不包含） | xGen UDI 引物* |
| PCR 扩增试剂 | xGen 2x HiFi PCR 混合液，包含 |
| 兼容的测序平台 | Illumina® 测序仪 |
| 兼容的杂交捕获封闭序列 | xGen Universal Blockers—TS Mix |
杂交捕获研究实验的完整流程
xGen cfDNA & FFPE DNA 文库制备 v2 机械剪切试剂盒经过优化，可与 xGen 杂交捕获探针和试剂无缝配合使用（图 2）。无论您的项目需要全外显子组测序还是定制探针组，IDT 均可提供适合您的捕获解决方案。
图 2. 杂交捕获和测序研究工作流程概览。
Syntezza Bioscience 成立于 2003 年，专注于在以色列提供先进的分子生物学产品和测序服务，我们是以色列的供应商。 Syntezza 为学术和政府研究机构、医院和 HMO 以及制药、农业、环境、生物技术和医疗诊断行业的企业客户提供服务。Syntezza经销IDT-Integrated DNA Technologies全系列DNA、RNA和CRISPR产品，IDT和MGI的NGS Library Prep试剂盒，GRiSP的研究试剂，BioBasic的定制基因和肽，BioBasic的定制mRNA和库存产品TriLink、GenTegra 的 DNA 和 RNA 稳定试剂盒以及内部开发的研究试剂。
