药物偶联物简介

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药物偶联物,特别是抗体药物偶联物(ADC),因其临床效果和潜在商业价值而受到广泛关注。而技术的进步导致了药物偶联物新旧理念的交织碰撞,甚至对现有的理念和技术提出了挑战。

如今,出现了多种新的缀合技术概念,包括肽药物缀合物(PDC)、小分子药物缀合物(SMDC)、免疫刺激抗体缀合物(ISAC)、抗体-寡核苷酸缀合物(AOC)、放射性核素药物缀合物( RDC)、抗体片段-药物偶联物(FDC)、适体药物偶联物(ApDC)、抗体细胞药物偶联物(ACC)、病毒样药物偶联物(VDC)等。此外,新的技术形式如抗体降解剂偶联物( ADeC)仍在不断涌现。本文简要介绍了几类药物偶联物的技术特点和代表性项目开发进展。

抗体药物偶联物 (ADC)

抗体药物偶联物(ADC)是目前最成功的药物偶联物类型,上市药物数量最多,具有良好的临床效益和商业价值。根据2021年《Nature Reviews Drug Discovery》发表的文章,到2026年全球ADC药物市场将达到164亿美元

ADC 旨在通过基于抗体靶向将细胞毒性药物引入癌细胞周围来减少全身暴露并提高安全性。该药物由三个主要成分组成:抗体(靶向)-连接器(将抗体与有效负载连接)-有效负载(杀死肿瘤细胞)。

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图1|抗体-药物缀合物构建体。图片来源:参考文献1

ADC药物的开发最早,但随着基于更先进技术开发的药物临床验证数据的增加,其面临的挑战也最大。首先,人们普遍认为抗体靶标应该被很好地内吞,但免疫刺激抗体偶联物 (ISAC) 表明也许不需要靶蛋白内吞。其次,传统观点认为抗原必须过度表达,而正常细胞不表达或低表达,而今年 ASCO 会议上 disitamab vedotin 的亚组分析显示,它对几乎所有 HER2 阳性和 HER2 低表达乳腺癌都有益处,以及Enhertu 也适用于 HER2 阳性和 HER2 低表达的肿瘤物种。第三,弹头的品种已经丰富,并不一定需要细胞毒性,免疫刺激剂和调节剂(STING、TLR、Treg)、蛋白水解靶向嵌合体(Protac)、寡核苷酸等药物也在临床或临床前研究中显示出初步有效性。

截至2022年12月,全球已有15种ADC药物获批上市,以及超过400种已公布的在研ADC候选药物,主要集中在肿瘤、罕见病和血液学治疗领域。有 136 种候选药物专注于共同靶标,其中 53 种针对HER2

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放射性核素抗体偶联物 (RAC)

放射性核素药物偶联物 (RDC) 与 ADC 类似,它们使用抗体或小分子(包括肽)介导的靶向来精确靶向细胞毒性/成像因子(放射性核素放射性同位素),以避免全身暴露的潜在危险。不同之处在于RDC负载是放射性核素,可用于诊断和治疗功能。其成分也与ADC略有不同,需要添加螯合毒素的特定官能团结构(螯合剂)。一般来说,它仍然由配体-连接体-有效负载组成。

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图 2. 放射性核素药物结合物 图片来源:imagingprobes

诺华2017 年以 39 亿美元收购了 Advanced Accelerator applications,其 RDC 药物 Lutathera(镥(177Lu)氧曲肽)自上市以来已成功商业化。 2018 年 10 月,以 21 亿美元收购 Endatory 后,又收购了其 PSMA 靶向放射性配体疗法 177Lu-PSMA-617。

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表 1. 近五年 FDA 批准的 RDC

在今年的 ASCO 会议上公布 VISION 研究结果后,177Lu-PSMA-617 被FDA授予突破性疗法称号。在转移性去势抵抗性前列腺癌的治疗中,177Lu-PSMA-617 显着改善了中位影像学无进展生存期(8.7 vs. 3.4 m)并延长了 OS,并将影像学进展或死亡风险降低了 60%。

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图 3 和图 4。Lutetium-177-PSMA-617,图像来源:ASCO 2021:

小分子药物偶联物 (SMDC)

小分子药物偶联物(SMDC)通常也由靶分子、接头和效应分子(细胞毒性分子、E3连接酶等)组成。

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图 5. 小分子-药物缀合物,图片来源:Network of Cancer Research

事实上,目前药物偶联物的过度细分也导致了不同概念药物之间的交叉。例如,肽药物偶联物(PDC),通常仍然属于小分子药物偶联物。 Lutathera,177Lu-PSMA-617,虽然根据毒素被归类为RDC,但其靶向配体均属于小分子领域。最近,PEPAXTO获批上市,Oncopeptides将其定位为肽-药物缀合物,但其分子结构并不是药物缀合物组合物的通常形式,或者应该属于前药缀合物(Pro-DC)或前药,在癌细胞周围分解,达到烷化剂样的肿瘤杀伤作用。

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图 6. PEPAXTO 的结构

因此,我们结合了小分子药物偶联物和肽药物偶联物的分析。小分子领域,Endatory产品Vintafolide有条件上市,但临床三期研究失败后撤市。

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表 2. 正在调查的 SMDC 和 PDC

免疫刺激抗体偶联物 (ISAC)

免疫刺激抗体偶联物(ISAC)的技术要求与ADC非常相似,不同之处在于ISAC负载的是先天免疫激动剂或调节剂,能够将冷肿瘤转化为免疫热肿瘤。此外,其功能与肿瘤微环境激活药物偶联物(TMAC)部分相似,均通过调节免疫刺激和微环境来实现免疫杀伤激活和治疗增敏。

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图 7. 免疫刺激抗体偶联物,图片来源:AACR2021

目前参与此类机制的药物主要有Toll样受体激动剂(TLR)型ISAC药物SBT6050、SBT6290、BDC-1001。 STING激动剂ISAC药物XMT-2056、Treg细胞调节ISAC药物ADCT-301等。不过,其中很多药物也被企业自己定义为ADC药物,或许也是因为两者在术语上并没有太多区别药物的外观性能和技术。

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图 8. BDC-1001,图片来源:BOLT BIOTHERAPEUTICS

抗体降解剂偶联物 (AdeC)

2021 年 6 月 16 日,瑞士公司 Debiopharm 和韩国公司 Ubix Therapeutics 联合宣布开展研究合作,结合 Multilink 和 Degraducer 两个专有技术平台开发 Antibody Degraducer Conjugates (ADeC)。

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图 9. 抗体-降解剂-缀合物

这种合作才刚刚开始,或许相关药物还没有被研究出来。然而,根据他们的平台技术,预计将开发的ADeC药物将是一种抗体药物缀合物,用降解分子取代有效负载,或许还携带其他有效负载以产生协同效应。 ETC。

ADeC的目的还在于将降解的分子携带至靶位点,避免全身暴露,甚至克服Protac分子的一些潜在成药性问题,如理化缺陷、特异性、PK等。

在 AdeC 领域,Orum Therapeutics 已开始临床前研究,并于最近完成了 8400 万美元的 B 轮融资,以继续推进其产品线。

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图 10. Orum 疗法

Orum Therapeutics 的技术还结合了与抗体偶联的蛋白质降解剂,其概念与 Debiopharm 和 Ubix 的技术相似,特别是降解剂,两者都具有泛素酶降解作用机制。

然而,两者也有所不同,Orum Therapeutics 将类别定义为抗体 neoDegrader 缀合物 (AnDC)。

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图 11. 抗体-neoDegrader-缀合物,来源:Orum Therapeutics

抗体片段-药物偶联物 (FDC)

抗体片段-药物偶联物(FDC),顾名思义,就是用较小的抗体片段(单链scFv)来替代较大的抗体分子。人们普遍认为抗体片段相对容易找到,并且可以通过生物工程实现更高的 DAR。

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图12.抗体片段-药物偶联物(FDC),来源:antikor网站

FDC在技术上与ADC几乎相同,但使用更小的片段抗体有望提高肿瘤渗透性并最大限度地提高药物疗效。小碎片和缺乏 Fc 可以在正常组织和循环中快速清除,从而降低毒性。

适体药物偶联物 (ApDC)

适体药物偶联物 (ApDC) 是药物偶联物的一种形式,它使用结构化寡核苷酸序列作为相应分子的靶标。核酸适体被称为“化学抗体”,具有与抗体类似的靶向和靶点结合特性。与抗体相比,核酸适配体还具有稳定性高、免疫原性低、生产成本低、易于化学修饰等诸多优点。

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图 13. 适体药物缀合物 (ApDC),来源:分子疗法:核酸

由于ApDC药物使用寡核苷酸序列,因此它们在接头和缀合策略方面可能与ADC药物不同,但在药物成分、作用机制和有效负载方面与ADC药物没有太大区别。

病毒样药物偶联物 (VDC)

病毒样药物结合物(VDC)是药物结合物的一种形式,它使用设计为非感染性蛋白质纳米颗粒(病毒样颗粒(VLP))的病毒衣壳作为有效的递送载体。

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图 14. 病毒样药物偶联物 (VDC),来源:Aura 网站

Aura采用人乳头瘤病毒(HPV)衍生的VLP选择性附着在修饰的硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPG)表面,以实现与实体瘤细胞或转移瘤的结合,但不与正常组织结合。AU-001是该机制的VDC产物。病毒样成分选择性地与HSPG结合,结合的红外光激活细胞被激活,选择性地破坏肿瘤细胞,导致肿瘤细胞急性坏死,同时激活免疫系统产生抗肿瘤反应。

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图 14.  AU-011,来源:  Aura 网站

抗体-寡核苷酸缀合物 (AOC)

抗体-寡核苷酸缀合物 (AOC) 是治疗性寡核苷酸利用抗体将siRNA(siRNA、PMO等)递送至特定细胞或组织,从而减少治疗患者疾病所需的药物量,并解决不可靶向和寡核苷酸递送的问题。寡核苷酸与靶向配体的缀合还可以改善寡核苷酸(治疗性RNA或DNA分子)的药代动力学特性并扩大其应用。与ApDC不同的是,AOC旨在实现寡核苷酸的靶向递送,阿斯利康已经对相关产品进行了研究。从技术上来说,AOC使用抗体作为传递介质,也可以假设小分子(包括肽)、蛋白质(酶)等也可以发挥相关功能。细分时,仅以寡核苷酸作为有效负载的药物也产生了各种概念产品。

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图 15. 抗体-寡核苷酸缀合物 (AOC),来源:avidity biosciences 网站

Avidity还基于此理念开发了AOC产品AOC1001,用于治疗强直性肌营养不良1型(DM1)疾病,并计划于2021年下半年进行相关临床研究。

结论

总而言之,现阶段的药物缀合物仍然保留相同的组成,即“配体-连接子-效应物”形式。由于技术的进步和药物剂型的繁荣,配体、连接臂和效应分子的定位有了更多的选择,导致了该领域的细分,并出现了多种药物缀合物的表达方式,如ADC、RDC、SMDC、 ISAC、ADeC、PDC、FDC、VDC、AOC 等。但过度的细分也造成了产品概念的混乱,即使是同一产品,不同企业的定义也存在差异。

本质上,大多数药物缀合物都是通过定位配体来达到靶向目的,以及不同功能的效应分子来达到治疗价值或临床目的;产品设计理念延续了ADC药物思路,不同的是三类成分(配体-连接体-效应分子)的转化。不过,ADC、RDC、SMDC和ISAC仍然是最成功的药物偶联物类型,并且已经有相关药物上市或多个临床药物处于概念验证阶段,而其他药物偶联物仍更多处于概念或阶段目前尚处于临床前阶段,能否实现临床价值还有待观察。


肽-药物偶联物(PDC):发展现状及研究进展

肽-药物偶联物(PDC):发展现状及研究进展

靶向抗癌药物一直是近年来药物研发的热点。随着抗体-药物偶联物(ADC)的成功,新型偶联药物不断涌现,如肽-药物偶联物(PDC)、放射性核素药物偶联物(RDC)、抗体-寡核苷酸偶联物(AOC)等。

目前,大多数新的缀合药物仍处于早期阶段,而PDC有相对较多的产品处于临床开发阶段,有望成为继ADC之后的另一个热点领域。

肽-药物偶联物(PDC)是继抗体-药物偶联物(ADC)之后的下一代靶向治疗药物,其核心优势是增强细胞通透性和提高药物选择性。截至目前,全球已有两款PDC药物获批上市,分别是诺华公司2018年开发的Lutathera和Oncopeptipes公司2021年开发的Pepaxto

肽-药物偶联物(PDC):发展现状及研究进展

ADC药物相比,PDC药物具有分子量小、肿瘤穿透性强、免疫原性低、生产成本低等优点。 PDC药物有望成为继小分子药物、单克隆抗体、ADC药物之后的新一代靶向抗癌药物。过去几年,多家制药公司一直致力于开发 PDC 药物,作为癌症、代谢性疾病等疾病的靶向治疗候选药物。本文介绍了PDC药物的发展现状及未来发展方向,希望为PDC药物研发带来参考价值

ADC 和 PDC 的比较

肽在人类生命中发挥着多种功能,如修复细胞、改善细胞代谢、防止细胞变性等。肽具有生物活性和良好的靶向转运能力。这一特性使其不仅适用于肿瘤学,还适用于糖尿病、风湿病和类风湿关节炎的靶向治疗。

PDC的结构与ADC类似,不同之处在于靶向单元。 ADC的靶向单元是抗体,而PDC是肽(图1)。PDC主要由多肽、链接链和细胞毒素组成。 PDC的作用机制也与ADC类似。靶向多肽与细胞毒素通过细胞内可分解的连接链共价连接,精准靶向肿瘤细胞的特异性受体,可控释放细胞毒素,从而杀伤肿瘤细胞。 PDC的分子量较小,因此表现出更好的膜渗透性。同时,PDC更容易被肾脏清除和代谢,这对于减少对肝脏和骨组织的毒性至关重要。此外,PDC的生产成本较低,载药量种类较多。因此,PDC是一种具有巨大研发前景和市场前景的靶向治疗药物。

肽-药物偶联物(PDC):发展现状及研究进展

图 2. PDC 和 ADC 的比较

研究表明,PDC药物比 ADC药物有更广泛的应用。除了癌症治疗之外,  PDCs还可以应用于许多其他疾病,作为抗癌药物递送的一种手段,PDC 具有共价修饰配体肽的优势,可以靶向肿瘤部位的特定细胞表面受体或生物标志物,以获得持久的疗效,从而赋予总体理想的药代动力学特征。这使得足够数量的药物能够被输送到癌症部位,同时最大限度地减少对健康组织的暴露并降低毒性。

癌症是一个重大的公共卫生问题。根据患者的分期和肿瘤类型,患者接受以下一种或多种治疗:手术、放射治疗或化疗。  2019年底以来,随着病毒大流行席卷全球,许多新的药物治疗策略应运而生。但药物治疗存在不同程度的毒副作用,有些严重的毒副作用是限制药物剂量或使用的直接原因。

通常,化疗会迅速抑制细胞有丝分裂,并产生严重的副作用。即使肿瘤被成功除,健康组织也可能会受到化疗的影响。幸运的是,靶向药物治疗可以有效区分肿瘤细胞的特征(包括细胞pH、细胞GSH含量、细胞形态和酶表达差异),从而改善患者不良预后并减少毒性。作为一种新兴的靶向抗癌疗法,PDC 可驱动肿瘤干细胞中有毒有效负载的积累,从而实现精确的药物治疗。然而,PDC药物面临的最大挑战是其体内转运不稳定,导致生物利用度低。

PDC的重要组成部分

PDC是一种结构和功能与ADC相似的靶向治疗药物,由不同类型的肽与药物连接而成。PDC由三个重要成分组成:归巢肽、连接链和细胞毒su药物。这三种成分协同作用,通过靶向肿瘤细胞上的受体来递送化疗药物,以放大其治疗效果。

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图3 PDC结构示意图

1. 归巢肽

PDC中的肽主要是细胞穿透肽(CPP)和细胞靶向肽(CTP)。目前,细胞穿膜肽在细胞膜上的摄取机制尚不清楚,细胞特异性较低,限制了细胞穿膜肽的应用。相反,细胞靶向肽是理想的载体,可以特异性结合肿瘤细胞表面受体(图3)并转运药物。常见的细胞靶向肽包括:铃蟾肽类似物、GnRH类似物、生长激素抑制类似物、RGD肽、PEGA等。

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图 4. 常见的肽靶向受体

(1).靶向肽的选择

研究表明,不同的肽会影响PDC内吞药物的效率,并对疗效、药代/药效特征、治疗指标产生显着影响。一般来说,理想的PDCs肽应具有较强的靶点结合亲和力、高稳定性、低免疫原性、高效内化和长血浆半衰期。归巢肽可以靶向肿瘤组织中特定的过表达蛋白受体,直接将药物递送至靶细胞并限制化疗药物的脱靶递送。这些归巢肽通常在纳摩尔浓度下对靶标具有高结合亲和力。

此外,归巢肽的二级结构显着影响其结合亲和力。研究发现,连接链可以通过稳定二级结构来提高归巢肽与靶标的结合亲和力。除了靶向特性外,一些肽还可以充当细胞穿透肽(CPP),其表现出疏水性、两亲性和促进跨膜渗透的负电荷等特性。细胞穿透肽可以将药物递送至靶组织并介导细胞内的药物内化。然而,带正电荷的 CPP 有一些缺点,例如目标选择性不稳定,导致非特异性细胞摄取。因此,带负电荷的 cpp 常用于 PDC 中以提高肿瘤细胞特异性。

肽和小分子具有显着不同的药代动力学特性。其中,多肽药物的最大缺点是生物利用度和药物摄取较低,而且多肽通常不能口服。因此,快速的肾脏清除和短的半衰期阻碍了肽的体内研究以及影响其药物形成特性的因素。有多种方法可以改善肽的 ADMTE 特性:

A。增加细胞通透性。
b.增强化学稳定性和抗蛋白水解能力。
C。降低肾清除率,延长循环半衰期。

(2)。提高肽稳定性和细胞通透性的策略

目前,常见的提高肽稳定性和细胞通透性的策略主要包括以下几种(图4):

A。肽的环状修饰。环化反应广泛应用于多肽的合成中,包括头尾环化、头尾环化、侧链环化、侧链与侧链环化等。肽吻合常用于确定肽的二级结构,如α螺旋和β折叠,可以提高肽与其靶标的结合亲和力,提高其ADME。
b.氨基酸修饰。增加肽稳定性的另一种方法是使用 D-构型氨基酸代替 L-构型氨基酸。这降低了蛋白水解酶的氨基酸序列、底物识别和结合亲和力。
C。与化学大分子结合的修饰。肽的电荷与肾清除率相关。带负电荷的肽比带正电荷的肽具有更长的半衰期。较高分子量(>450 kDa)的肽可以增加肽的亲脂性。此外,PEG链修饰、PSA修饰、HES修饰、脂肪链修饰等修饰方法也可以增加多肽的半衰期。
d.改变剂型。细胞内蛋白质递送系统通常依赖于遗传蛋白质与基于阳离子脂质体、聚合物和无机纳米材料的膜穿透标签和蛋白质封装载体的融合。已报道了几种通过剂型提高肽治疗药物口服生物利用度的方法,例如添加渗透促进剂和耐酸包衣等。

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图5 肽的修饰策略

2. 连接链

连接链的选择是PDC设计的关键因素之一。需要考虑PDC的微环境,以免干扰肽与其受体的结合亲和力及药效。根据长度、稳定性、释放机制、官能团、亲水性/疏水性等特性,PDC 中使用不同类型的连接体。PDC 中使用的连接链必须表现出稳定性,以防止过早和非特异性药物释放。

连接链分为两大类:可裂解链和不可裂解链(图 5)。可裂解的连接链可以通过酶或化学方法裂解。其中,化学可裂解的连接链包括:PH敏感的连接链、二硫键连接链和外源刺激裂解的连接链。不可裂解的连接链不能被外部刺激激活,并且不可裂解的连接链在肽代谢释放有效负载后起作用。虽然可裂解接头在靶向治疗的开发中更有利,但不可裂解接头在体内代谢循环中更稳定。因此,可裂解或不可裂解接头的选择取决于靶向治疗剂的设计和作用模式的需要。

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图 6. 环链的类型

3. 载药类型

有毒性药物是杀死肿瘤过程中重要的一部分。 PDC进入细胞后,毒素药物是最终导致靶细胞死亡的因素。因此,有毒性药物的毒性和理化性质可以直接影响药物杀伤肿瘤的能力,从而影响其疗效。一般来说,细胞毒素必须具备四个要求:作用机制明确、分子量小、细胞毒性高、与肽化学缀合后保留抗肿瘤活性。然而,每种有毒性药物通常都有其局限性,如PK性能较差等。此外,有毒性药物的非选择性是最大的缺点,会引起严重的副作用。由于化疗药物附着在肽上,因此需要较低的细胞毒性剂量。所以,所选的化疗药物通常具有较强的抗增殖活性。 PDC的化疗药物包括阿霉素、紫杉醇、喜树碱等。还包括放射性核素、177Lu装备。  

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图 7. PDC 中的载药类型

PDC最新研究进展

迄今为止,全球已开发并上市两种PDC药物:Lutathera,由诺华于2018年批准,Pepaxto,由Oncopeptipes于2021年开发。Lutathera是诺华开发的第一个全球批准的PDC药物,属于新兴的肽受体放射性核素治疗(PRRT)。狭义上,该药物还可归类为放射性核素药物缀合物(RDC)。 Pepaxto是一种first-in-class肽缀合药物,严格来说,它是第一个获批的PDC药物。遗憾的是,同年10月22日,Oncopetides宣布撤回Pepaxto在美国市场,主要是因为在验证性III期OCEAN研究中,Pepaxto未能降低ITT人群的死亡风险。此外,还有多个PDC处于临床试验阶段,PDC赛道竞争激烈。

肽-药物偶联物(PDC):发展现状及研究进展

图8. 进入临床试验并获批上市的PDC药物

结论

PDC是多肽与化疗药物的组合,它结合了多肽的选择性和化疗药物的高抑制活性。 PDC通过修饰肽的氨基酸序列,可以改变缀合物的疏水性和电离性,解决水溶性和代谢差等问题,同时促进细胞通透性,有助于进一步的临床开发。此外,较低分子量的 PDC 更容易纯化。

PDC可以显着提高治疗效果,同时还可以降低毒性,提高治疗窗,在肿瘤治疗中具有更广阔的应用前景。尽管肽具有较小的分子量和更快的肾脏清除率,但这些问题已通过多种方法得到有效解决,包括化学修饰和物理技术(环化、结合肽、剂型)。

PDC是抗癌的一个新的研究领域,但仍存在许多问题有待解决。幸运的是,基于adc药物的成功研发,PDC研究或许可以有一些捷径,少走一些弯路。同时,随着研发技术的创新,PDC研究将逐步得到临床验证,从而推动该领域的发展,带来更多的治疗选择。

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几种基于核酸的PROTAC简介

几种基于核酸的PROTAC简介

近年来,核酸药物发展迅猛,市场需求不断增加,上市审批迅速,涵盖心血管与代谢疾病、肝病、肿瘤等多个领域。截至目前,全球已有10余种核酸药物获批上市,不少核酸药物正处于临床试验阶段。核酸药物有望成为继小分子药物、抗体药物之后的第三类药物(图1)。

几种基于核酸的PROTAC简介

越来越多经批准的核酸疗法证明了通过靶向体内致病基因来治疗疾病的潜力。通常,常规治疗只产生短期治疗效果,因为它们针对的是蛋白质而不是疾病的根源,而核酸药物则直接作用于致病的靶基因或靶mRNA,在基因水平上发挥治疗疾病的作用。核酸药物包括ASO、siRNA、Aptamer、miRNA、mRNA、saRNA、sgRNA、U1 snRNA等。核酸药物具有治疗效率高、毒性低、特异性强、应用领域广泛等优点,显示出其重要的医学价值、生物科学等领域。

PROTAC(蛋白水解靶向嵌合体)是一种利用泛素-蛋白酶体系统(UPS)降解靶蛋白的药物开发技术。从结构上看, PROTAC由三部分组成:E3泛素连接酶配体和靶蛋白配体,两个活性配体通过专门设计的“Linker”结构连接在一起,形成三元复合物。 PROTAC的靶蛋白配体与靶蛋白结合,E3泛素连接酶配体与胞内E3泛素连接酶的底物结合区结合,从而通过泛素化靶蛋白,将靶蛋白“拉”到E3泛素连接酶上,使 UPS 系统能够降解目标蛋白(图 2)。

几种基于核酸的PROTAC简介

过去20年来,研究人员基于肽和小分子设计了各种形式的PROTAC。然而,基于肽的PROTAC存在活性低和免疫原性等问题,极大地限制了其临床医学应用。与多肽PROTAC相比,小分子PROTAC体积更小,更容易被人体吸收,成药性更好,因此小分子PROTAC仍然是主流。随着科学技术的发展和进步,一些新型的PROTAC不断出现,基于核酸的PROTAC应运而生。

RNA-PROTAC

RNA 结合蛋白 (RBP) 的功能缺陷是许多疾病的根源,而用常规药物靶向 RBP 已被证明是困难的。 RBP 以动态、协调和序列选择性的方式与 RNA 结合,形成核糖核蛋白 (RNP) 复合物,在 RNA 依赖性中发挥关键作用。某些疾病是由 RBP 的基因变化引起的,影响了 RBP 与 RNA 的结合。

RNA-PROTAC 的新型嵌合结构来靶向 RBP。 2021年,Jonathan Hall研究小组提出基于RNA的PROTACs的设计理念,作者成功构建了靶向 RBP(RNA 结合蛋白)的 RNA-PROTAC。使用小 RNA 模拟物作为靶向基团,它们可以特异性结合 RBP RNA 结合位点。 PROTAC 泛素化 RBP,然后通过泛素蛋白酶体系统降解它们。作者对两种 RBP(干细胞因子 LIN28 和剪接因子 RBFOX1)的降解进行了概念验证,并展示了它们在癌细胞系中的用途。 RNA-PROTACs靶向Lin28蛋白,这是一种干细胞因子和癌蛋白,是多种疾病的潜在药物靶点,具有很高的研究价值。

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TF-PROTAC

转录因子(TF)是治疗包括癌症在内的疾病的一类重要治疗靶点。由于TFS缺乏激酶或其他酶中常见的活性或变构位点,传统的小分子抑制剂很难与其结合。因此,转录因子一度被认为是“不可成药”的靶点,存在难以逾越的技术瓶颈。哈佛大学Wenyi Wei教授和西奈山伊坎医学院Jian Jin教授报道了一种基于寡核苷酸链的“ TF-PROTAC “,它由DNA寡核苷酸和E3配体通过点击反应连接而成(图4),并能选择性地降解致病性TF。 TF-PROTAC 的选择性取决于所使用的 DNA 寡核苷酸。

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作者成功开发了两个系列的基于VHL的TF-PROTAC:NF-κB-PROTAC(dNF-κB)和E2F-PROTAC(dE2F),分别有效降解细胞内的内源性p65和E2F1蛋白,并表现出优异的抗-细胞增殖作用(图5)。几种基于核酸的PROTAC简介

2021 年,Crews 团队还报道了靶向转录因子 (TF) 的寡核苷酸 PROTAColigoTRAFTAC(图 6)。OligoTRAFTAC由与 TF 和 E3 泛素连接酶配体结合的寡核苷酸链组成。几种基于核酸的PROTAC简介

蛋白质印迹实验表明,oligoTRAFTAC 成功降解了两种致癌转录因子:c-Myc 和 brachyury。此外,作者发现oligoTRAFTACs可以成功降解脊索瘤细胞系的brachyury,并且在随后的体内斑马鱼模型实验中也表现出良好的降解活性(图7)。几种基于核酸的PROTAC简介

基于适配体的PROTAC 

适体是寡核苷酸(DNA 或 RNA)序列。寡核苷酸片段通常通过指数富集配体系统进化(SELEX)体外筛选从核酸文库中获得。核酸接头因其可以与多种目标物质以高特异性和选择性结合而被广泛应用。 2021年,谭卫红课题组基于核酸适配体AS1411:ZL216设计了PROTAC(图8)。

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AS1411可以特异性靶向肿瘤细胞中高表达的核仁素受体,核仁素受体与其配体结合后被内化。作者通过体外实验证明PROTAC具有较高的水溶性和血清稳定性。此外,作者发现ZL216促进乳腺癌细胞中核仁素受体-ZL216-VHL三元复合物的形成,并在体外和体内有效诱导核仁素受体降解。随后的细胞增殖和迁移实验表明,ZL216还抑制乳腺癌细胞的增殖和迁移(图9)。几种基于核酸的PROTAC简介

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适体-PROTAC 缀合物 (APC)

PROTAC是一种很有前景的靶向蛋白质降解策略。作为一种有效的靶向蛋白质降解方法,PROTACs在催化性能、高选择性、克服耐药性、有效阻断非成药靶点等方面显着优于传统小分子药物。但PROTAC一般具有高分子量和高疏水性,其理化性质很大程度上超过了“五法则”(RO5)。因此,传统PROTAC的药物开发往往受到其细胞膜通透性差、药代动力学(PK)特性差以及缺乏肿瘤特异性靶向的限制。

为此,盛春泉课题组提出了Aptamer-PROTAC Conjugates(APCs)的设计理念。 APC 是通过可裂解的连接链将 PROTAC 靶向 BET 蛋白与适体 AS1411 (AS) 偶联而获得的(图 10)。其中,核酸适体AS1411可以选择性靶向肿瘤细胞表面高表达的核仁素受体。 AS本身对核仁素受体过表达的肿瘤具有良好的抑制活性,目前正在II期临床试验中进行评估。肿瘤细胞中谷胱甘肽含量丰富,因此连接链选择可被谷胱甘肽(GSH)裂解的二硫键,可选择性响应肿瘤微环境,在连接链裂解后释放活性BET降解剂。

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图 10. APC 的设计策略

与未修饰的BET PROTAC(PRO)相比,APC缀合物(APR)在McF-7细胞的小鼠异种移植模型中表现出改善的肿瘤靶向能力,从而增强BET蛋白的体内降解和抗肿瘤效力。因此,APC策略为肿瘤特异性靶向PROTAC的开发提供了新的设计思路。

几种基于核酸的PROTAC简介

图11 蛋白质降解实验及体内成像、抗肿瘤实验

适配体PROTACs Conjugates (APCs)的发展自提出以来可谓“惊天动地”。与传统PROTAC相比,基于核酸的PROTAC提高了传统小分子PROTAC的靶向性,在提高水溶性、膜通透性、肿瘤靶向性等方面发挥着重要作用。由于核酸药物在体内易被核酸酶水解,半衰期短,极大限制了其在生物医学中的应用。未来的研究方向应集中于提高核酸药物的稳定性、延长半衰期、改善药代动力学性质、解决核酸药物递送问题。 

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用于详细分析药物抗体比 (DAR) 和载药量分布的稳健方法

用于详细分析药物抗体比 (DAR) 和载药量分布的稳健方法

用于详细分析药物抗体比 (DAR) 和载药量分布的稳健方法


平均药物抗体比 (DAR) 和载药量分布是抗体药物偶联物 (ADC) 的两个重要特性。多年来,已经开发了几种ADC 生物分析方法,以更好地估计这些特性,以用于早期开发和常规质量控制应用。在本文中,我们概述了详细分析这些分子中 DAR 的使用的方法,并指出了每种方法的优点和局限性。

抗体药物偶联物 (ADC) 是小细胞毒性药物的高效靶向递送系统。 ADC 的有效负载通过可裂解或不可裂解的接头与抗体共价结合,是这些生物治疗药物的生物活性成分。然而,这些系统的复杂性通常会导致显着的异质性,需要对每个单独的组件和缀合分子作为一个整体进行广泛的表征,然后才能被认为适合临床应用。

药物抗体比 (DAR)药物载量或 DAR 分布是 ADC 的两个主要关键特性。 DAR定义为与抗体缀合的药物分子的平均数量。相反,药物负载或 DAR 分布定义为抗体载体上存在的缀合药物数量的化学计量分布。 DAR 值决定了 ADC 的功效和安全性。高 DAR 可能会阻碍 ADC 的药代动力学特性,而低 DAR 会显着限制这些疗法的效力。理想情况下,DAR 分布值应在 2-4 之间。

已经开发了几种方法来以越来越高的精度测量这些特性。然而,这些系统固有的异质性以及抗体载体中复杂的翻译后修饰的存在使得这种表征在分析上具有挑战性。

目前,这些属性是使用以下方法测量的:

  • 药物与抗体的比率(平均DAR):

    • 紫外可见 (UV/Vis) 光谱

    • 组织蛋白酶-B酶切法

  • 载药量分布

    • 毛细管电泳(CE)

  • 关键属性:

    • 疏水相互作用色谱 (HIC)

    • 反相高效液相色谱(RP-HPLC)

    • 质谱(MS)

用于 DAR 测定的紫外-可见 (UV/VIS) 光谱

紫外/可见光谱是用于 ADC 表征的方法。该方法传统上用于确定蛋白质浓度,它依赖于测量不同波长 (λ) 下的吸光度。该方法的先决条件是:(i)有效负载必须具有紫外/可见发色团; (ii) 抗体和有效负载应具有特点的最大吸光度波长(λ最大值,前者通常为 280 nm); (iii) 药物不得干扰抗体的吸收光谱,反之亦然。

如果 ADC 符合所有先决条件,则可以根据吸光度值和消光系数计算两种组分的浓度。随后,平均 DAR 可以简单地通过将平均药物浓度除以平均抗体浓度来估计。

尽管这种方法通常用于估计 ADC 的 DAR,但它存在重要的局限性。例如,ADC 样品中游离药物的存在可能导致 DAR 值的高估。此外,紫外/可见光谱不提供任何有关药物负载分布的信息,而药物负载分布是一个同样重要的特性。因此,该方法保留用于常规质量控制操作,并且在新 ADC 的早期开发过程中很少使用。

用于 DAR 测定的组织蛋白酶 B 酶切法

组织蛋白酶 B 是一种溶酶体酶,负责用肽接头切割 ADC 构建体。最近开发了基于组织蛋白酶 B 的 DAR 测定酶法。该方法涉及使用多种酶和还原剂进行一系列处理,以允许结合药物的释放。随后通过色谱分离对处理后的游离药物进行定量

ADC 首先用IdeS 蛋白酶预处理,产生 F(ab')2 和 Fc 片段,然后用2-巯基乙胺(2-MEA) 还原,以进一步裂解为 Fdʹ、Fc 和 Lc。这种复杂的预处理可确保更好地进入结合位点并更有效地切割有效负载。在这些步骤之后,用组织蛋白酶 B进行消化,然后通过 RP-HPLC-UV 进行蛋白质组分的分离。

由于两种组分在药物定量之前被分离,因此该方法克服了 UV/Vis 方法所施加的最常见限制 –药物和抗体组分需要不同的 λ 最大值此外,这种方法也被认为比质谱法更精确,质谱法的质量信号通常会受到疏水性和净蛋白质电荷的影响,而疏水相互作用色谱 (HIC)在分析随机缀合的 ADC 时可能会受到分辨率效率低的影响。

基于组织蛋白酶 B 的方法最重要的限制是无法辨别药物负载分布。此外,由于该方法的复杂性,其用于质量控制目的的实施仍然具有挑战性。因此,该方法在早期开发或抗体研究环境中仍然更有用。

用于药物载量分布测定的毛细管电泳 (CE)

毛细管电泳(CE)具有仪器简单、规格小型化、分离高效快速、进样量少、分辨率高等特点。已经测试并实施了不同的 CE 方法来表征 ADC,包括毛细管凝胶电泳 (CE-SDS)、毛细管等电聚焦 (cIEF)、成像 cIEF (iCIEF)、毛细管区带电泳 (CZE) 和毛细管电泳-质谱法 ( CE-MS)。所有这些方法都为 ADC 提供了不同级别的表征,例如异构体、乙二醇分析和翻译后修饰等。

与基于组织蛋白酶 B 的方法一样,CE 方法也是最近才开发出来的。因此,很少有文献可以支持他们。然而,在这些方法中,iCIEF 始终取得了有希望的结果。该技术允许根据 ADC 电荷变体的等电点 (pI) 对其进行分离。通过这种方式,可以有效分离未结合的抗体和具有不同载药量的不同 ADC 种类,有助于监测批次间的一致性、载药量分布和未结合的抗体。其缺点是该技术仅在基于赖氨酸的缀合 ADC 上进行了测试。因此,目前尚不清楚它是否可以应用于其他共轭化学。

用于详细 DAR 分析的疏水相互作用色谱 (HIC)

疏水相互作用色谱 (HIC) 的工作原理是在疏水固定相上运行反盐梯度。固定相根据样品成分的疏水性保留和分离样品成分,并且由于该方法使用温和的条件,因此在分析过程中保留了复杂蛋白质种类的天然构象。因此,HIC 方法可用于测量平均 DAR并确定ADC 中的药物负载分布。

在分析非共价蛋白缀合物(例如半胱氨酸连接的 ADC)时,温和条件的使用使得该技术极其方便。这些缀合物通常在 RPLC(反相液相色谱)等更严格的色谱方法中解离,使得 HIC 成为这些生物药物详细 DAR 分析的参考技术。

HIC 技术在分析基于赖氨酸和位点特异性的缀合 ADC 时效率相当低。此外,该技术分离未结合分子的能力仍然有限,因为这些物质仅被部分解析。然而,由于最近开发了新的色谱柱和分离方案,HIC 仍然是半胱氨酸连接 ADC药物载量分布分析的黄金标准。

用于详细 DAR 分析的反相高效液相色谱 (RP-HPLC)

反相高效液相色谱 (RP-HPLC) 广泛用于表征药物蛋白质。与基于 HIC 的表征相比,RP-HPLC 的优点是由于流动相的挥发性,该方法与质谱法的兼容性。相比之下,HIC 使用与 MS 研究不相容的盐梯度。 RP-HPLC 或简称 RPLC(反相液相色谱)作为分析平均 DAR、载药量分布、未缀合抗体和游离药物接头种类的方法有着成功的记录。

对于半胱氨酸连接的 ADC,RPLC 是 HIC 的最合适替代品,可用于详细的 DAR 分析。然而,该方法的主要缺点之一源自已知会破坏半胱氨酸连接的 ADC 天然构象的恶劣分析条件,通常导致轻链和重链解离。为了克服这一限制,ADC 通常在分析前用还原剂进行预处理。在这种情况下,轻链和重链更容易分离和单独评估。或者,ADC 也可以用 IdeS 进行预处理并进行化学还原以生成 Fc、LC 和 Fd 片段。

无论 RPLC 中 ADC 分析所用的方案如何,寻找合适的色谱条件仍然具有挑战性。对于赖氨酸连接的 ADC,RPLC 分离提供的分辨率通常不足以区分具有不同载药量的完整 DAR 种类。因此,该方法对于平均 DAR 测定有效,但在分析赖氨酸连接 ADC 中的药物负载分布时具有挑战性。相比之下,位点特异性缀合 ADC 可以通过 HPLC 或基于 HIC 的方法轻松分析。

一般来说,独立于缀合化学(半胱氨酸、赖氨酸或位点特异性),RPLC 可以作为平均 DAR 质量控制的可靠方法,并且对于检测杂质的存在非常有用。此外,RPLC 方法可用于估计 ADC 稳定性并量化游离药物分子,使其可用于新型 ADC 的广泛早期表征及其生产工艺的优化。

用于详细 DAR 分析的质谱 (MS)

质谱 (MS) 分析取决于分析物的电离效率,并包含多种强大的高分辨率技术。目前用于分析大生物分子的 MS 光谱仪使用电喷雾电离 (ESI)结合飞行时间 (TOF)Orbitrap,这有助于不同 ADC 物种在还原或非还原条件下获得高分辨率。

由于这些方法的敏感性,通常建议用 PNGase F 预处理 ADC,以消除 N-聚糖引起的异质性,N-聚糖通常会掩盖或干扰 MS 分析。流行的替代方案包括将 ADC 还原为重链和轻链、抗体载体的酶促片段化或两者的组合。此外,对于通常电离效率特别低的赖氨酸连接的 ADC,研究人员已成功去除有效负载的疏水部分,成功提高了检测灵敏度。

预处理通常可以对 ADC 进行更详细的结构分析,包括以高精度和灵敏度检测低丰度 ADC 物种。

结束语

本文涵盖的所有不同方法都应被视为互补的。事实上,使用不同方法获得的结果的比较有助于在平均 DAR、药物负载分布、未缀合抗体含量和游离有效负载连接体含量方面获得更准确的 ADC 分子指纹。此外,大多数这些技术的性能和准确性在很大程度上取决于共轭化学。因此,在早期开发过程中应使用多种方法来确保这些生物药物的正确和广泛的表征。

尽管基于质谱的方法在分辨率方面仍然是好的,但将其用于常规质量控制通常并不可行。因此,通常应选 HIC 或 CE 等替代方法来加快 ADC 生产和质量控制。

proteogenix 抗体-药物偶联物简介

proteogenix 抗体-药物偶联物简介

抗体药物偶联物 (ADC) 是一类新兴药物,旨在向临床靶标输送剧毒货物(有效负载)。在 ADC 中,有效负载是药物活性成分。因此,它们决定了这些疗法的总体有效性。直到最近,ADC 有效负载的开发几乎集中在细胞毒性药物和癌症靶标上。但随着连接化学的安全性和有效性不断提高,可用于生成新 ADC 的有效负载的多样性也在不断增加。

什么是药物有效负载?

有效负载是 ADC 的三个主要组件之一。它们是高活性和有毒的药物分子,通过化学接头连接到抗体上。有效负载可以是小分子、蛋白质毒素、生物活性肽、酶,甚至放射性核素。

抗体药物偶联物 (ADC) 的效力取决于其在肿瘤细胞和组织中的细胞毒性有效负载的最终浓度。反过来,该浓度取决于 ADC 表面上有效负载的分布、缀合物稳定性和药物的总体细胞毒性。为 ADC 选择适当的有效负载取决于目标的性质、结构和分布以及其他属性。

如何为 ADC 选择有效负载?

早期的 ADC 使用先前已批准用于临床的药物有效负载。然而,这些药物由于毒性低,导致结果不佳,从而为 ADC 的研究带来了新的方向。研究人员很快发现,对于非靶向临床应用来说,ADC 的最佳有效负载是那些被证明毒性太大的有效负载。

目前,有效的有效载荷是能够在纳摩尔或皮摩尔范围内杀死癌细胞的有效载荷。此外,为了有效,有效负载还需要具有相当的可溶性、非免疫原性(小),并且具有可与接头缀合的反应位点。最后,药物必须与 ADC 的连接基化学相容:可裂解或不可裂解。

大多数有效负载可以与可裂解的接头缀合,因为作为对化学或物理信号的响应,这些分子桥在目标附近被去除。相反,不可切割的接头稳定地附着在其有效负载上。因此,在估计有效负载的毒性时必须考虑连接体的存在,因为这种类型的化学通常会影响细胞毒性药物的结构和活性。

ADC 开发中常用的细胞毒性有效负载有哪些?

为 ADC 开发的大多数细胞毒性有效负载属于两个主要家族:微管蛋白抑制剂(美登木素生物碱、auristatin 或紫杉醇衍生物)和DNA 修饰剂(主要是加利刹霉素)。所有这些药物都在纳米和皮摩尔范围内表现出强大的细胞毒性——毒性太大而无法全身给药。

微管蛋白抑制剂有效负载在细胞生长过程中通过有丝分裂停滞引起细胞死亡而发挥作用。由于其有利的生化特性,它们代表了主要的有效载荷类别。此类中最著名的化合物是单甲基 auristatin E (MMAE) 和 F (MMAF),这两种合成化合物均源自天然抗有丝分裂药物多拉司他汀 10。目前,几种已批准的 ADC 携带 MMAE,包括 brentuximab vedotin、polatuzumab vedotin 和 enfortumab vedotin。

相比之下,DNA 损伤剂的作用与细胞的生长过程无关。它们经常被描述为分子剪刀,因为它们能够切割基因组 DNA,从而导致细胞死亡。目前正在积极临床开发的其他类型的药物有效负载包括 RNA 修饰药物(鹅膏毒素)、蛋白质毒素、抗生素和酶。

有效载荷等级 作用机制 例子
奥利他汀类 微管蛋白聚合酶抑制剂 单甲基奥里斯他汀 E (MMAE) 和单甲基奥里斯他汀 F (MMAF)
美登素 微管蛋白解聚 美登木素生物碱(DM1 和 DM4)
加利车霉素 DNA切割 加利车霉素γ1
双金霉素 DNA小沟烷化剂 CC-1065 和多卡霉素 SA
吡咯并苯二氮卓类 (PBD) 二聚体 DNA小沟交联剂 PBD衍生物
鹅膏毒素 RNA聚合酶II抑制剂 α-鹅膏蕈碱
蛋白质毒素或免疫毒素 一些 假单胞菌外毒素 (PE) 和白喉毒素 (DT)
抗生素 一些 4-二甲氨基哌啶-羟基苯并恶嗪利福霉素 (dmDNA31)
一些 β-葡萄糖醛酸酶、脲酶等

一般来说,术语ADC是指抗体和小药物之间的结合。最后三类有效负载由大分子组成,由于药效学受阻和作用机制不同,这些大分子带来了不同的挑战。例如,与抗生素的结合被认为是 ADC 的新兴子类,通常被称为抗体-抗生素结合物(AAC)。这些结合物的出现是由于多重耐药细菌的日益流行和抗生素管道的减少。 AAC 由于其特异性而提供了传统抗生素疗法的替代方案,可以在不干扰健康微生物群的情况下针对特定的致病菌群。

同样,与酶的缀合通常称为抗体-酶缀合物。这些缀合物通常采用两步策略,包括与缀合物一起使用前药。该前药作为无毒前体,可以全身给药,并且只有在 ADC 酶促部分存在的情况下才能转化为其毒性形式。目前正在进行独立于前药的酶缀合物的开发。

由于大型生物活性分子带来了一系列的挑战,酶和抗生素缀合物都被认为独立于传统的 ADC 开发。

这些有效负载可以作为游离药物(即,当使用可裂解接头技术时)、作为接头-有效负载复合物(即,当使用不可裂解接头技术时)或封装在纳米载体内递送至其特定靶点。在 ADC 开发中使用纳米载体是一个相对较新的研究领域。这些载体包括基于脂质的颗粒,例如脂质体和聚合物分子。它们旨在为每个 ADC 封装大量药物,增强其药代动力学和分布,保护药物免于过早降解,增加疏水性药物的溶解度,并增强其跨细胞膜的扩散。

总之,纳米载体试图减轻单克隆抗体表面可用缀合位点数量有限所带来的问题,同时最大限度地提高每种抗体可以递送至其预期靶标的浓度。然而,目前抗体-纳米载体缀合物尚未进入市场。

ADC 有效负载的未来

ADC 开发中最大的挑战之一是平衡有效负载功效与 ADC 安全性。这两个特性不仅取决于有效负载的固有毒性,还取决于药物与抗体的比率 (DAR) 和连接体化学的稳定性。目前正在开发几种方法,试图增加抗体和小药物有效负载之间的协同作用。这些策略大多数集中在接头化学的改进以及 ADC 与其他疗法(例如免疫检查点抑制剂)的组合上。

然而,与其他研究领域相比,新型有效载荷的开发已经滞后。该市场主要由 auristatins 和美登木素生物碱衍生物主导,PBD 二聚体在 ADC 应用中慢慢占据一席之地。 ADC 开发有效负载选择受到限制的原因与合成方面的限制有关。用于快速合成有效负载的前体的可用性仍然是该过程中具限制的步骤。

目前,专家认为,有效负载方面的改进应侧重于开发具有成本效益的前体,以实现快速合成和增强药物溶解机制(例如,使用纳米载体)。