炔烃或叠氮化物修饰的蛋白质与染料叠氮化物或炔烃的缀合
蛋白质标记缓冲液适用于 CuAAC 与蛋白质的反应,可保护生物分子免受活性氧的损害。该反应可用于具有炔烃或叠氮基团的蛋白质,以及用叠氮基团代谢标记的细胞或细胞裂解物的组分。
叠氮化物与末端炔烃缀合,形成五元杂环(1,2,3-三唑)。这两个基团(叠氮基和炔烃)在天然生物分子中都极为罕见,因此该反应具有高度特异性,可以有效地处理各种任务。
该反应在铜 (I) 化合物存在下进行,几乎不依赖于 pH 值。蛋白质标记缓冲液针对蛋白质操作进行了优化,含有铜 (II) 盐(催化活性铜 (I) 化合物的稳定前体)、醋酸三乙铵 pH 6.8、水溶性 THPTA 配体和氨基胍。建议使用新鲜配制的 抗坏血酸溶液减少铜(II)。蛋白质标记缓冲液中的 THPTA 配体通过稳定铜 (I) 的催化活性化合物来加速反应。 THPTA 配体的存在还允许在水介质(无有机溶剂)中进行蛋白质标记,并且由于铜 (I) 氧化程度的稳定,最大限度地减少活性氧 (RAS) 的产生,并防止它们通过氧化组氨酸、蛋氨酸来损坏蛋白质和半胱氨酸。蛋白质标记缓冲液中的氨基胍可防止化学反应性醛(脱氢抗坏血酸水解产物)与精氨酸、N 末端半胱氨酸和赖氨酸的侧链结合。
对于此反应,您将需要无叠氮钠缓冲液中的炔烃或叠氮化物修饰的蛋白质、叠氮染料或 炔烃、1.5х蛋白质标记缓冲液和抗坏血酸。建议在惰性气体(氮气或氩气)下执行步骤 6 至 9。
协议
我们推荐以下方案用于修饰蛋白质与染料衍生物的缀合:
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根据要使用的修饰蛋白的量确定总反应体积:
!炔烃或叠氮化物修饰的蛋白质溶液的体积不应超过总反应体积的1/3。
总反应体积,μL |
蛋白质含量 |
100 |
4至20纳摩尔 |
200 |
20至40纳摩尔 |
400 |
40至80纳摩尔 |
600 |
80 至 600 纳摩尔 |
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使用下表计算标记反应的试剂体积:
试剂 |
体积,微升 |
原液浓度 |
染料叠氮化物或炔烃 |
(蛋白质含量 [nmol])× 0.3* |
10 mM DMSO 或水 |
蛋白质标记缓冲液 |
(总反应体积[μL])×0.67 |
1.5倍 |
活化剂(抗坏血酸) |
(总反应体积[μL])×0.02 |
50 mM 水中 |
水 |
(总反应体积 [μL] – 染料溶液体积 [μL] – 蛋白质标记缓冲液体积 [μL] – 活化剂溶液体积 [μL]) |
— |
* 染料过量可能会根据蛋白质分子上叠氮化物或炔基的数量而变化。表中显示的计算结果为 3 倍过量的染料。对于 1.5–10 倍过量的染料,将蛋白质含量 (nmol) 乘以 0.15–1。但请记住,如果您使用不溶于水的叠氮化物或炔烃,则过量时它可能会从反应混合物中沉淀出来。使用水溶性染料,例如磺化花青染料sulfo-Cyanine。
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准备 染料叠氮化物或炔烃(10 mM 溶于 DMSO 或水中,适用于水溶性炔烃和叠氮化物)和活化剂(抗坏血酸,50 mM 水溶液)的储备溶液。
请记住,抗坏血酸在空气中很容易氧化。仅使用新配制的活化剂溶液 (该溶液在 1 天内稳定)。要制备储备溶液,请将 10 mg 抗坏血酸溶解在 1.1 mL 水中。
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将蛋白质标记缓冲液添加到修饰的蛋白质溶液中并涡旋。
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添加计算体积的叠 氮化染料或炔烃储备溶液,并再次涡旋均匀。
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(推荐)对混合物进行脱气以除去氧气。为此,将一次性移液器吸头连接到塑料或硅胶管,该管连接到装有惰性气体(氩气或氮气)的气瓶的压力调节器。打开非常弱的气流,放入管中,使其比液面高 3-10 毫米,避免接触液体和管壁。气流应在液体中形成漩涡而不溅出液体。将保持在该位置 10-20 秒。
如果同时进行多个标记反应,可以使用离心浓缩器进行脱气。为此,将管子放入浓缩器中,打开旋转,打开真空 30-40 秒,然后关闭真空,同时向系统输入端输送惰性气体。
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添加活化剂溶液(抗坏血酸),然后用惰性气体吹扫管几秒钟并关闭它。
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涡旋溶液。
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让混合物在室温下静置 8-16 小时。
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使用透析或尺寸排阻色谱分离染料-蛋白质缀合物。