使用 Pico488 进行 DNA 定量
Pico488 DNA 定量溶液是一种超灵敏试剂，用于在无法通过测量 260 nm 吸光度来确定双链 DNA 浓度时测量双链 DNA 浓度。 Pico488 选择性地结合双链 DNA，因此核苷酸、单链 DNA、RNA、蛋白质和其他杂质不会妨碍测量。与双链 DNA 结合的染料在 503 nm 处最大吸收光并在 525 nm 处最大发射光。为了检测测定读数，可以使用任何类型的荧光计或荧光板读数器。
Pico488 测量 DNA 浓度的线性范围为 1 pg/μL — 5 ng/μL。为了实现精确、可重复的荧光测量，我们建议在 TE 缓冲液（10 mM Tris-HCl，pH 7.5，1 mM EDTA）中稀释 DNA 和 Pico488。为了计算 DNA 浓度，我们建议首先使用一系列 DNA 标准稀释液建立校准曲线。
Lumprobe 销售各种包装的Pico488 DNA 定量溶液和Pico488 DNA 定量试剂盒。除了 Pico488 溶液之外，该试剂盒还包括缓冲液和 DNA 标准储备溶液。如果测定体积等于 2 ml，则试剂盒提供的染料溶液量足以分析标准荧光比色皿（体积 3.5 ml）中的 200 个实验数据点。如果使用其他类型的设备来检测荧光，则可以重新调整测定范围。下表提供了常用荧光设备的推荐检测体积。
协议
1. Pico488工作液的制备
解冻 Pico488 染料瓶中的内容物，充分混合，并用缓冲液将所需量的 Pico488 染料溶液稀释 200 倍（我们建议使用 10 mM Тris HCl、1 mM EDTA，pH 7.5）。混合并在3小时内使用。每个实验数据点的 Pico488 工作溶液体积应等于测定体积的 50%（查看下表以查找适合您的荧光测定设备类型的推荐体积）。为所有实验数据点（针对您计划分析的所有样品和所有 DNA 标准稀释液）准备足够的 Pico488 工作溶液。还包括额外 10-25% 的 Pico488 工作溶液体积，以排除可能的移液错误。要计算稀释后的 Pico448 的体积，可以使用以下公式：
V Pico488 = 5/8 × V测定× (N 个样品+ N 个标准品)， 其中 V测定是样品或标准品的测定体积，mL，N 个样品 是您计划分析的样品数量，N 个标准品是您计划分析的标准品数量（包括空白样品）。
2. 样品溶液的制备
在缓冲液中稀释 DNA 样本，使溶液体积等于测定体积的 50%（您可以使用任意量的 DNA）。添加等体积的 Pico488 工作溶液。混合并孵育 5 分钟。同样，制备 DNA 标准品的稀释液。请注意，DNA 标准品的稀释度应在样品中 DNA 浓度的范围内。 DNA 标准储备液仅随Pico488 DNA 定量试剂盒提供。Pico488 DNA 定量解决方案的用户 应使用自己的 DNA 标准品。
使用Pico488 DNA 定量溶液进行 DNA 定量的推荐体积：
| 设备类型 | 测定体积 | 稀释后的 Pico488 体积 | 稀释 DNA 体积 |
|---|---|---|---|
| 标准荧光比色皿（3.5 ml） | 2毫升 | 1毫升 | 1毫升 |
| 其他荧光比色皿 | 约比色皿体积的 75% | 比色皿体积的 37.5% | 比色皿体积的 37.5% |
| 96 孔板*，每孔 | 0.2毫升 | 0.1毫升 | 0.1毫升 |
| 24 孔板，每孔 | 1毫升 | 0.5毫升 | 0.5毫升 |
| 其他板材 | 约占井容积的75% | 井体积的37.5% | 井体积的37.5% |
| NanoDrop™ 3300* | 0.1毫升 | 0.05毫升 | 0.05毫升 |
* 为了保持测量的准确性和精密度，我们建议避免移液量低于 2 µL。
3. 荧光测量
使用适当的吸收和发射波长或滤光片测量标准和样品 DNA 溶液的荧光（双链 DNA 结合的 Pico488 染料吸收最大波长为 503 nm 的光，发射最大波长为 525 nm 的光）。
4. DNA浓度的计算
绘制荧光与 浓度的关系图，并在任何软件中应用线性回归函数，以获得反映荧光 ( FL ) 与浓度 ( C ) 依赖性的线性方程：
FL = A × C + B。
要计算稀释样品中的 DNA 浓度，请使用以下公式：
C样品= (FL样品 — B)/A，其中FL样品是样品溶液荧光。
要计算未稀释样品中的 DNA 浓度，请使用以下公式：
С init = V Assay × C Sample / V init，其中 V Assay是测定体积（mL），V init是初始 DNA 样品的体积（μL）
或者，您可以使用我们的dsDNA 定量和稀释 计算器完成所有必要的计算。
线性回归示例：荧光与 DNA 浓度
