小分子药物聚乙二醇化方法

小分子药物聚乙二醇化方法

聚乙二醇(PEG)是乙二醇的聚合物,相对分子质量为200~8000或以上。由重复的乙氧基组成,不仅具有良好的水溶性,而且易溶于苯、乙腈、乙醇等有机溶剂。 PEG分子的特点如下:

①低分散性:相对分子质量(Mr)小于5000的分散性为1.01,分子量(Mr)大于5000的分散性为1.1,具有较宽的范围。分布和更大的选择性;
②两亲性:既溶于有机溶剂又溶于水;
③无毒:研究表明大于1000的聚乙二醇无毒,已用于各种食品、化妆品和药品中;
④ 可生物降解:聚乙二醇在体内直接消除,结构不发生任何变化。分子量小于20000的代谢物可以通过肾脏代谢,较大分子可以通过消化系统代谢。

聚乙二醇化药物的特点

大多数蛋白质药物、多肽药物、化学药物都伴有一些自身无法克服的问题,如作用时间短、免疫原性大、副作用大等。 PEG呈中性、无毒,具有很好的理化性质和良好的生物相容性,是美国FDA批准用于体内注射药物的少数化学品之一。因此,通过化学方法将活化的聚乙二醇与蛋白质、肽、小分子药物和脂质体连接,即对药物分子进行聚乙二醇化,可以有效提高药物分子的生物半衰期,降低其毒副作用。可以减少影响。其中,研究最多的是蛋白质的PEG修饰。与未修饰的蛋白质药物相比,
聚乙二醇化的蛋白质药物具有以下优点:

(1)生物活性更强;
(2)脂质体对肿瘤有更强的被动靶向作用;
(3)较长的半衰期;
(4)降低最大血药浓度;
(5)血药浓度轻微波动;
(6)酶促降解少;
(7)免疫原性和抗原性较低;
(8)毒性较小;
(9) 溶解性更好;
(10)减少用药次数;
(11)提高患者依从性,改善生活质量,降低治疗费用。

小分子药物聚乙二醇化方法

聚乙二醇化方法

鉴于聚乙二醇化对药物性质的巨大影响,聚乙二醇化已成为药物开发和提高已上市药物疗效的重要途径。因此,如何进行PEG化就成为重中之重。

首先,需要选择合适的PEG进行分子修饰。修饰剂的选择主要考虑以下5个方面:

(1)
选择PEG相对分子质量(Mr)的确定应同时考虑生物活性和药代动力学因素。应用太大的聚乙二醇化蛋白药物会导致药物失去大部分生物活性。当使用低Mr(<20000)聚乙二醇化蛋白质药物时,修饰后的蛋白质药物与原型药物相比,生物活性和药代动力学性质没有本质变化。因此,一般选择40000-60000范围内的PEG作为修饰。
(2)修饰位点的选择应基于对蛋白质构效关系的分析。选择不与受体结合的蛋白质表面残基作为修饰位点,使得修饰后的蛋白质能够保留较高的生物活性。常见的修饰位点有氨基修饰、羧基修饰和硫醇修饰;
(3) PEG修饰剂与氨基酸反应的特异性取决于修饰剂的化学性质和修饰位点的选择。
(4)PEG修饰剂的水解稳定性和反应活性取决于活化基团的稳定性和修饰反应条件尤其是pH值的控制。一般来说,PEG修饰剂反应活性高,因此稳定性较差,容易水解;
(5)聚乙二醇化蛋白的活性、毒性和抗原性与聚乙二醇修饰的大小和类型有关。一般情况下,随着PEG相对分子量的增加,蛋白质活性的损失逐渐增加。此外,不同的PEG修饰剂对蛋白质生物活性的影响也不同。

其次,激活PEG。聚乙二醇化蛋白质主要是通过PEG末端羟基与蛋白质氨基酸残基反应实现的。 PEG末端羟基活性较差,必须用活化剂活化才能在体内温和条件下共价修饰蛋白质。常见的PEG活化方法有:

(1)羰基二咪唑法:该方法首先用于多肽的合成,并已被证明是形成酰胺键的良好试剂。

小分子药物聚乙二醇化方法
羰基二咪唑活化PEG

(2)N-羟基琥珀酰亚胺法: (a)活化N,N-琥珀酰亚胺碳酸酯。该反应需要在无水条件下进行。 (B) 活化琥珀酸酐和N-羟基琥珀酰亚胺。该方法得到的聚乙二醇具有较高的活性。最好在非水环境中进行蛋白质偶联。

小分子药物聚乙二醇化方法
N,N-琥珀酰亚胺碳酸酯活化的 PEG

小分子药物聚乙二醇化方法
琥珀酸酐和 N-羟基琥珀酰亚胺活化的 PEG


(3)氰尿酰氯法:氰尿酰氯又称三氯嗪(TST),是一种对称杂环化合物。 David 使用 TST 与聚乙二醇上的羟基发生反应。只有一个氯原子被取代,其他氯原子与蛋白质氨基反应。

小分子药物聚乙二醇化方法
氰尿酰氯活化的 PEG

(4)光气活化法:Kurfuerst提到了由N-羟基琥珀酰亚胺钾盐、硝基苯酚、三氯苯酚与光气反应制备活化聚乙二醇的方法。激活分为两个步骤,如下图所示。

小分子药物聚乙二醇化方法
PEG的光气活化

(5)聚乙二醇对蛋白质半胱氨酸残基进行化学修饰。磺基特异性修饰的常见PEG活化方法如下图所示。

小分子药物聚乙二醇化方法
硫醇激活的 PEG 的特异性修饰

(6)连接酶位点的聚乙二醇:除了传统的化学修饰方法外,还可以通过酶催化等其他方式实现修饰,以G-TGase为例。

小分子药物聚乙二醇化方法
酶联聚乙二醇


最后选择合适的蛋白质氨基酸残基位点或小分子药物位点进行位点特异性修饰。用活化的PEG对合适的蛋白质氨基酸残基进行位点特异性修饰可以提高天然蛋白质的功效。蛋白质药物PEG修饰技术最大的问题是无法实现位点特异性修饰,修饰产物不均一,给分离纯化带来很大困难,也极大阻碍了临床应用。根据蛋白质的氨基酸性质和PEG衍生物的特点,科学家在使用PEG进行修饰时,选择不与受体结合的蛋白质表面残基作为修饰位点。这样,修饰后的蛋白质药物除了具有聚乙二醇化带来的优异性能外,还具有较高的生物活性。目前上市药物中常见的修饰位点包括氨基、羧基、磺基、二硫基、糖基以及非极性氨基酸的一些特定位置。

什么是生物光学标记?

什么是生物光学标记?

生物光学标记是指用具有光学特性的标记物对生物分子进行标记,从而达到检测和识别的目的。根据应用光学特性的不同,通常可分为荧光分子标记、荧光蛋白标记、生物发光标记、化学发光标记等。根据标记目的,包括生物分子标记、生化标记、细胞学标记、形态标记等。

生命分子的探测、生命过程的观察、特定生物组织的识别通常因其微观性和隐蔽性而难以直接观察,甚至超出仪器的检测范围。它可以“脱颖而出”并借助相应仪器进行检测。

对目前检测方法可以检测到的特定生物分子、细胞或组织进行标记并检测分子和纳米颗粒,然后通过检测分子/颗粒的数量和分布来获取特定分子、细胞或组织的特征,进而获得某些区域以及细胞或生物体内分子、生化、生理指标的反应和信号。这种标记过程通常称为生物标记。生物光学标记是指用具有光学特性的标记物对生物分子进行标记,从而达到检测和识别的目的。根据应用光学特性的不同,通常可分为荧光分子标记、荧光蛋白标记、生物发光标记、化学发光标记、根据标记目的,包括生物分子标记、生化标记、细胞学标记、形态学标记等。

生物光学标记物,由于采用光学方法,借助成熟的光学高灵敏度检测仪器,可以实现高对比度、高分辨率、高灵敏度、高信噪比,方便快捷地进行检测。选择作为主要生物标志物方式。特别是荧光蛋白发现后,生物光学标记得到了快速的应用发展。 Osamu Shimomura、Martin Charfie 和 Roger Tsien 因其对绿色荧光蛋白的发现和研究而获得 2008 年诺贝尔化学奖。生物光学标签现在广泛用作生命科学和医学研究中的示踪剂。

生物光学标记研究和应用的历史
在生物研究中,科学家经常使用发出荧光的荧光分子作为生物标记。通过将这种荧光分子化学连接到其他不可见的分子上,以前不可见的部分变得可见。生物学家一直在使用这种标记方法将原本透明的细胞或细胞器“拉”出暗显微镜视野。

传统荧光分子发光时会产生有毒的氧自由基,导致观察到的细胞死亡,这就是“光毒性”。因此,在绿色荧光蛋白发现之前,科学家只能通过荧光标记的方式进行研究。死细胞的静态结构,或者其毒性作用不得不暂时忽略,而活细胞只能观察很短的时间,而荧光蛋白的光毒性很弱,非常适合标记各种活细胞。

1962 年,这种荧光蛋白在一种名为维多利亚多管发光水母的水母中被发现。其基因产生的蛋白质在受到蓝色波长光激发时会发出绿色荧光。发光过程还需要发光蛋白水母发光蛋白的帮助,而这种蛋白还需要与钙离子(Ca)相互作用。

GFP 的光毒性非常弱,非常适合标记活细胞。然而,从绿色荧光蛋白被发现到用于标记生物样品,却花了20多年的时间。 1993年,Martin Schalfi通过基因重组成功使水母以外的其他生物(如大肠杆菌等)产生绿色荧光蛋白。他不仅证实了绿色荧光蛋白与生物体的相容性,而且建立了利用绿色荧光蛋白研究基因表达的基本方法,而现代许多重大疾病都与基因表达异常有关。

后来,美籍华人钱永健系统地研究了绿色荧光蛋白的工作原理,并对其进行了大刀阔斧的化学改造,不仅大大增强了其发光效率,而且开发出了红色、蓝色、黄色荧光蛋白。 ,使荧光蛋白真正成为生物学家根据需要进行选择的工具箱。生物实验室常用的荧光蛋白大多是钱永健修饰的变体。

有了这些荧光蛋白,利用光学仪器,科学家们似乎在细胞中安装了“灯塔”,让它们能够实时监测各种生命过程。通过沙尔菲的基因克隆思想,科学家迄今已培育出荧光小鼠和荧光猪。
此外,除了上述荧光分子和荧光蛋白标记外,2000年以来,随着生物纳米技术的发展,一些新型的、生物相容性的光学纳米标记也得到了研究和开发,如上转换纳米粒子、量子点等。 、长延时荧光粒子等都已被研究和利用。它被用作细胞和活体的生物标记,作为生物光学成像“传感”的有力的工具。

生物光学标记的类型和应用
荧光分子/纳米颗粒标记
荧光分子包括有机试剂或金属螯合物;荧光纳米粒子包括上转换、量子点等,在紫外-可见-近红外区域具有较强的特征荧光。用这种分子/纳米颗粒标记细胞和活体后,可以实现光学示踪检测,或者激发和发射波长、强度、寿命和偏振等荧光特性可以随着极性、折射率等环境特性的变化而敏感地改变、粘度和生物检测可以利用这一特性进行。荧光分子/纳米颗粒标记设计灵活,应用方便。

生物发光标记
生物发光标记是利用荧光素酶(Luciferase)基因来标记细胞或DNA的生物标记方法。标记后,细胞合成荧光素酶,然后添加外源荧光素酶。下面,荧光素氧化后发光。该方法使研究人员能够直接监测生物体中的细胞活动和基因行为。通过该系统,可以观察活体动物中肿瘤生长和转移、传染病的发展以及特定基因的表达等生物过程。由于其操作极其简单、结果直观、灵敏度高,已广泛应用于生命科学、医学研究和药物开发。

荧光蛋白标记荧光蛋白
将基因片段与目的基因连接,转染细胞,正常表达后,可在激发光下用荧光显微镜、流式细胞仪或激光共聚焦显微镜观察检测。荧光蛋白包括绿色荧光蛋白(GFP)、红色荧光蛋白(RFP)、蓝色荧光蛋白(BFP)和黄色荧光蛋白(YFP)。它对活细胞无害,并且可以长时间观察。因此被广泛应用于转基因动物、融合标记、基因治疗、活细胞中蛋白质功能定位和迁移变化、病原菌侵入活细胞的分子过程等研究。荧光蛋白作为新一代基因转移报告基因和/或定位标记在生命科学研究中受到越来越多的关注

化学发光标记
将可发光的化合物附着到待检测分子(蛋白质、核酸等)上的方法。也可以连接半抗原(如生物素等),然后与酶标抗半抗原抗体或亲和素结合,与半抗原上的酶标抗体或亲和素结合。可以催化化学发光底物发生化学变化而发光。例如,抗体分子用吖啶酯标记,被触发器激活后发光,用于检测固相抗原。

血液中含有什么以及它是在哪里制造的?

血液中含有什么以及它是在哪里制造的?

血液的成分

血液是悬浮或溶解在水中的细胞、蛋白质、离子、糖、信号分子、营养物质和气体的复杂动态混合物。血液也会重新分配热量。血液的成分随着我们的饮食、运动状态、水分、一天中的时间、损伤和病原体的挑战而不断变化。血液制品除了在哺乳动物中发挥重要作用外,还具有重要的离体应用。例如,血清和白蛋白是细胞培养的重要试剂。血液是怎样制造的?血液的成分是什么?血液的这些成分从何而来?

血液中含有什么以及它是在哪里制造的?

血液的成分。血液的一些主要成分的例子。添加抗凝剂并离心后的血液外观如左侧所示。稻草色的血浆位于红细胞上方,红细胞被一层称为血沉棕黄层的白细胞隔开。成分大致按大小顺序排列,范围从细胞到包括水在内的小分子。对于抗体和较小的分子,使用空间填充分子结构。有关组件的进一步说明,请参见下表。图片来源:Cell Guidance Systems 和 Bigstock(脂蛋白和 EPO 图形)。  


血液是由许多不同的器官产生的

当血液在全身流动时,沿途的各种器官和组织都有助于其成分的产生。其中一些组织和器官,例如骨髓,主要专注于产生血液成分,而其他组织和器官,例如肝脏,则具有许多其他重要功能。血液除了携带营养、氧气和免疫系统细胞外,还携带激素、细胞因子和 RNA 等信号分子遍布全身。信号分子可以携带在细胞外囊泡例如外泌体中。这些脂质和蛋白质的小空心球与靶细胞有效融合,释放其生物活性成分。血液还将废物从组织运送到身体的器官,例如过滤和分泌废物的肝脏、肺和肾脏。所有这些成分都有不同的寿命和从血液中去除的机制。下表重点介绍了它们的功能和起源。组件按其尺寸的大致顺序列出。 

血液的主要成分、功能和来源 

成分

功能

来源

气体

新陈代谢所需

空气通过肺部
二氧化碳

新陈代谢的废物

所有细胞和空气都通过肺部

其他分子的组成部分

空气通过肺部
笑气

血管扩张剂

所有细胞

溶剂

水 

血液其他成分的液体载体和体内细胞的水合来源。    

通过消化系统摄入和吸收。 

小分子

盐类

维持渗透压,细胞功能的离子来源。当总体盐含量过高时,大脑会感觉到这一点,使我们感到口渴

通过消化系统摄入和吸收。 
代谢物

细胞产生的废物在血液中运输并主要通过肾脏和肝脏清除。 

所有细胞
糖类

能量之源

通过消化系统摄入和吸收。 
维生素和营养素

细胞功能和新陈代谢所需 

通过消化系统摄入和吸收。皮肤(维生素D)

信号分子

细胞因子和生长因子。  小蛋白质信使分子。请参阅这篇文章了解更多详细信息。   它们是由所有细胞产生的。
荷尔蒙

信使分子可以是蛋白质,例如胰岛素,也可以是化学物质,例如甲状腺素。 激素的例子包括:

从多种来源分泌
雌激素

女性性器官的发育调节月经周期。 

卵巢
睾酮

男性性器官、肌肉组织和面部毛发的发育。 

主要由睾丸产生,但也来自其他来源(例如卵巢)
胰岛素

调节血液浓度。 

胰腺
胰高血糖素

调节血液浓度。 

胰腺
肾素

有助于血压控制。 

肾脏
甲状腺素

三碘甲状腺原氨酸的前体。 

甲状腺
三碘甲状腺原氨酸 

控制新陈代谢率。

肝脏、肾脏及其他
内啡肽

阻止疼痛。 

垂体前叶
抗利尿激素  

刺激肾脏的水潴留。 

由下丘脑制造,由垂体分泌

主要血液蛋白质

白蛋白

血清白蛋白是血浆中的主要蛋白质。白蛋白结合并运输激素、脂肪酸和其他化合物。白蛋白具有缓冲 pH 值、维持渗透压等功能。 

由肝脏制成
抗体 

以数百万种不同形式生产以识别外来蛋白质。 

由 B 细胞在 T 细胞的帮助下产生(见下文)。
纤维蛋白

排列成长链的不溶性蛋白质。促进凝血。 

由凝血酶与纤维蛋白原作用而形成。
纤维蛋白原 

一种糖蛋白复合物,在损伤期间转化为纤维蛋白。 

由肝脏制成 
血红蛋白

血红蛋白与氧气结合,将其从肺部输送到体内的其他组织。血红蛋白还运输血液中约 75% 的二氧化碳以供呼出。血红蛋白包装在红细胞中,以防止其对脉管系统和暴露的组织造成氧化破坏。 

红骨髓

脂质(脂肪)

胆固醇

对于构建细胞壁、制造激素、胆汁酸和维生素 D 非常重要。过量会导致心脏病。可以与蛋白质结合成脂蛋白(见下文)

由肝脏产生,也通过消化系统从食物中吸收
甘油三酯

在两餐之间提供储存的能量来源。可以与蛋白质结合成脂蛋白(见下文)

由食物、脂肪细胞提供,在肝脏中产生。 

脂蛋白

(脂质和蛋白质的复合物)  

乳糜微粒——最大的脂蛋白 

从肠道携带甘油三酯。

食品
极低密度脂蛋白(VLDL)

运输肝脏中产生的甘油三酯。


低密度脂蛋白(LDL)

运输肝脏中产生的胆固醇。这种胆固醇就是低密度脂蛋白胆固醇。它通常被认为是坏胆固醇。

高密度脂蛋白(HDL)

将多余的胆固醇从动脉壁和细胞中清除回肝脏进行回收和处理。一般认为不错。

动脉壁

细胞外囊泡

细胞外囊泡 (EV)

不同大小的小空心球,具有含有蛋白质和 RNA 货物的脂质壁。包括由活细胞产生的外泌体(50-200nm)、微粒(200 nm 至 1 µm)以及由死亡细胞产生的凋亡小体。外泌体提供信使功能,每毫升的含量约为 1×10 12。 

由所有细胞产生。

血小板

血小板 

小的圆盘状碎片有助于在受伤组织中形成凝块。它们是由巨核细胞的细胞质形成的。它们的比例约为每 20 个红细胞 1 个,寿命为 7-10 天。

巨核细胞存在于骨髓和肺中

红细胞

红细胞

约占总血容量的40%。它们的主要作用是提供血红蛋白的包装。

红骨髓

 

白血细胞

白细胞(白细胞)

以每 600-700 个红细胞 1 个白细胞的比例存在。抵抗感染并帮助重塑受损组织。白细胞也称为白细胞

骨髓、胸腺
淋巴细胞

一种白细胞,进一步分为单个细胞类型 

骨髓、胸腺
T细胞。

对抗感染和癌症等疾病。 

胸腺
自然杀伤细胞。

先天免疫系统的一部分通过攻击病毒感染的细胞来对感染做出初步反应。 

骨髓
B细胞。 

适应性免疫细胞产生针对病原体的抗体。 

骨髓
中性粒细胞

最常见的淋巴细胞约占总数的50%。吞噬病原体的吞噬细胞。

骨髓
单核细胞

吞噬病原体的吞噬细胞。从血液转移到发炎组织,在那里分化成巨噬细胞,巨噬细胞可以协调免疫反应和组织重塑。 

骨髓
嗜酸性粒细胞

杀死寄生虫,破坏癌细胞,并参与过敏反应。 

骨髓
嗜碱性粒细胞 

参与过敏反应

骨髓
巨噬细胞

将它们归类为白细胞可能是错误的,因为它们主要不是在血液中发现的。巨噬细胞是吞噬细胞,可以起源于它们所在的组织(组织驻留巨噬细胞),并且在从血液通过毛细血管壁渗入组织后也可以从单核细胞分化。

骨髓和其他组织

 


什么是生物素化?

什么是生物素化?

生物素化,也称为生物素标记,是将生物素共价连接到蛋白质、核酸或其他分子的过程。生物素化快速、特异,并且由于生物素尺寸小(MW=244.31 g/mol),因此不太可能干扰分子的天然功能。生物素(维生素 H)以高的亲和力、快速的结合速率和高特异性结合链霉亲和素和亲和素,这些相互作用在生物技术的许多领域中用于分离感兴趣的生物素化分子。生物素与链霉亲和素和亲和素的组合可耐受高温、pH 和蛋白水解,这使得在各种环境下捕获生物素化分子成为可能。类似地,多个生物素分子可以与靶蛋白缀合,从而可以组合多个链霉亲和素、亲和素或中性亲和素蛋白分子,提高了检测目的蛋白的灵敏度。有许多生物素化试剂可以利用各种可能的标记方法。由于生物素和链霉亲和素之间的强亲和力,生物素化蛋白质的纯化已广泛用于鉴定蛋白质-蛋白质相互作用和翻译后事件,例如分子生物学中的泛素化。

什么是生物素化?
生物素的化学结构。生物素也称为维生素H、维生素B7或维生素B8,是一种水溶性B族维生素。该分子有两个环(脲基和四氢噻吩部分)通过一侧稠合在一起。生物素是羧化酶的辅酶,是合成脂肪酸、异亮氨酸和缬氨酸所必需的。生物素也参与糖异生。


生物素化试剂和溶解度

生物素化试剂的溶解度极大地影响标记靶蛋白或其他大分子的能力。蛋白质具有基于氨基酸侧链和蛋白质构象的疏水性和亲水性区域,并且这些区域可以基于试剂的溶解度促进或限制生物素化。此外,基于试剂的溶解度,靶蛋白微环境的疏水性可以阻止或允许生物素化。例如,表面生物素化是研究表面分子表达或内体运输的常用方法。它要求生物素化试剂是亲水性的,以防止其穿过疏水性的细胞膜,从而限制生物素标记在细胞表面。所以,合适的生物素化试剂的选择取决于目标氨基酸和蛋白质或大分子的微环境。

生物素化试剂的溶解度基于反应部分、间隔臂或两者的组合的溶解度。一些反应基团本身带电,因此是水溶性的,而不带电的基团则需要进行修饰(例如磺化)。使间隔臂可溶的常见方法是掺入
聚乙二醇(PEG),它具有高溶解性和柔韧性。由PEG组成的间隔臂可以使具有不带电反应基团的生物素化试剂变得可溶,或者使具有带电反应基团的生物素化试剂更易溶解。此外,与非生物素化蛋白质相比,含有 PEG 的生物素标签带来的溶解度增加有助于防止生物素化蛋白质在长期储存过程中聚集。

Biochempeg 提供先进的生物素化试剂、用于提高生物稳定性和生物利用度的
PEG 生物素、肼化学和点击化学生物素、紫外线可追踪生物素。

PROTAC的发展概述

PROTAC的发展概述

临床上使用的大多数药物都是基于小分子的。与传统的小分子抑制剂和拮抗剂不同,蛋白质降解技术由于能够诱导治疗靶点蛋白质的降解,近年来发展迅速,为新药的开发提供了新的思路。

PROTACs(PROteothesis-Targeting Chimeras)的概念最早由Crews等人提出。 2001年,PROTACs可以利用体内天然的蛋白质清洁系统来降低蛋白质水平而不是抑制蛋白质功能,从而治愈疾病。 PROTAC是一种异双功能分子,看起来像哑铃,分子的一端连接到结合靶蛋白的配体,一端连接到E3泛素连接酶,中间有合适的接头。 PROTAC对目标蛋白的降解是通过泛素蛋白酶体系统(UPS)实现的:PROTAC分子与目标蛋白(POI)和E3连接酶结合形成三元复合物,对目标蛋白进行泛素化标记,泛素化蛋白被泛素化酶识别并降解。细胞内蛋白酶体26S。

PROTAC的发展概述

2022年6月9日,清华大学饶宇教授团队在Nature旗下Signal Transduction and Targeted Therapy杂志上发表了题为“ PROTACs:学术界和工业界的巨大机遇(2020年至2021年更新) “的综述文章,详细介绍了 近两年PROTAC技术的研究进展,总结了PROTAC针对癌症、病毒感染、免疫疾病、神经退行性疾病的代表性新靶点。

PROTACs新靶点研究进展

近20年来,PROTAC领域进入了快速发展期,特别是2015年以Pomalidomide为E3连接酶配体的dBET1 PROTAC成功降解BET蛋白以来,近两年PROTAC相关研究论文不断涌现。经历了爆发式增长。 2019年,饶宇团队总结了40多个据报道被PROTAC降解的蛋白质靶点。近两年新增了约90个可被PROTAC降解的蛋白靶点,涵盖癌症、免疫紊乱、病毒感染、神经退行性疾病等疾病领域,其中癌症是主要应用领域。

PROTAC的发展概述

图2.近两年PROTAC相关研究的快速发展
(Signal Transduct Target Ther, 7(1): 181.)

统计,基于PROTAC技术的不同降解剂可降解约54种激酶,占总靶点的45%。激酶已被优选作为蛋白质降解的靶标,主要是因为大多数激酶具有已知且有效的抑制剂或配体,可以轻松修饰以连接接头并保持足够的结合亲和力。此外,激酶具有深层结合袋,可促进 PROTAC 的结合,从而诱导激酶与 E3 连接酶的相互作用,进而泛素化并最终降解激酶。此外,尽管激酶蛋白具有高度同源性,PROTAC 仍可以选择性降解不同激酶亚型。

迄今为止,已发现518种激酶,参与细胞生存、增殖、分化、凋亡、代谢等多种生理调节过程。如下图所示,这些激酶根据其结构和功能可以分为九类,即受体酪氨酸激酶(RTKs)、TKL激酶(TKLs)、STE激酶(STEs)、CAMK激酶(CAMKs)、AGC激酶(AGC)、CMGC 激酶 (CMGC)、非典型蛋白激酶、CK1 激酶 (CK1) 等。其中,红色标记的是人类可降解激酶,具有现有的PROTAC降解剂。受体酪氨酸激酶(RTK)和CMGC激酶(CMGC)的PROTAC降解剂最为发达,分别有19个和14个,占总数的一半以上。相比之下,CK1 激酶 (CK1) 和 CAMK 激酶 (CAMK) 尚未开发出 PROTAC 降解剂。

PROTAC的发展概述

图 3. 基于 PROTAC 技术的可降解人类激酶及其分类
(Signal Transduct Target Ther, 7(1): 181.)

PROTAC新技术

由于PROTACs是在POI抑制剂的基础上发展起来的,因此仍然存在一定程度的脱靶效应。由于PROTAC的分子量较大,其细胞膜通透性差和药代动力学(PK)特性大大降低了其生物学和治疗效果。此外,有些PROTAC虽然能有效诱导靶蛋白降解,但其生物学作用较弱,对疾病没有有效作用。最后,大多数蛋白质没有相应的小分子缀合物来设计PROTAC,例如在疾病发展中发挥重要作用的转录因子。由于转录因子的抑制剂很少,因此在设计靶向转录因子的PROTAC时没有可用的粘合剂。这极大地限制了PROTAC技术的应用。 为了解决上述问题,近年来出现了不同类型的PROTAC技术,例如抗体-PROTAC、适体-PROTAC缀合物、双靶点PROTAC、叶酸笼式PROTAC和TF-PROTAC

抗体-PROTAC

Antibody-PROTAC是一种探索新型抗体-PROTAC缀合物与抗体组装的新策略。该技术能够对不同细胞和组织中的蛋白质进行特异性降解,从而优化治疗窗口,减少广谱 PROTAC 的副作用,并增加其作为药物或化学工具的潜力。

适体-PROTAC 缀合物

适配体是具有复杂三维结构的单链核酸,主要包括茎、环、发夹和G4聚合物。它们通过氢键、范德华力、碱基堆积力、静电效应等特殊作用与靶蛋白结合,具有较高的特异性和亲和力,可提高传统PROTAC的水溶性、膜通透性和肿瘤靶向性。

双目标PROTACS

在癌症的发生和发展过程中,通常有多种因素共同作用,包括不同种类的激酶和生长因子,它们可以独立作用,也可以通过信号网络相互干扰。该方法主要是设计一个结合两个或多个药效团的单一分子,同时靶向两个或多个抗肿瘤靶点。

叶酸笼式 PROTAC

叶酸受体 α (FOLR1) 在正常组织中表达较低,但在许多人类癌症中表达较高。叶酸笼式 PROTAC 是另一种提高 PROTAC 靶向特异性的技术。基本原理是将叶酸基团引入PROTAC分子中,实现在靶细胞和组织中的释放。该技术中,叶酸通过细胞内源性水解酶的作用释放出活性PROTAC,然后降解剂诱导目标蛋白的降解。

TF-PROTAC

转录因子(TF)是一类参与基因表达和调控的蛋白质,也是癌症治疗的潜在靶点。与传统激酶不同,转录因子不具有激酶或其他酶中常见的活性口袋或变构调节位点,这使得它们难以被小分子抑制剂靶向。由于TF可以结合特定的DNA序列并调节转录过程,因此理论上可以靶向具有不同DNA序列的TF而不是小分子抑制剂。因此,TF-PROTAC将靶向蛋白的小分子配体替换为相应的DNA序列,从而形成TF-PROTAC,靶向特异性TF,并诱导其降解,从而调节特异性TF的水平和生物学功能。

PROTAC的发展潜力

与其他药物和疗法相比,  PROTACs具有许多潜在的优势,例如广泛的组织分布和口服给药。与其他疗法(如细胞疗法、抗体药物等)相比,PROTAC的生产工艺更为简单。与小分子药物相比,PROTAC可以靶向更多小分子药物无法靶向的靶点,从而产生更好的疗效。因此,PROTAC技术受到业界高度关注,并开始应用于癌症、免疫紊乱、病毒感染、神经退行性疾病等药物研发,其中以癌症领域的应用为主一。

PROTACs作为一项新兴且有前景的技术,在以下方面显示出巨大的发展潜力。

首先,PROTAC 对耐药靶点表现出异常的敏感性。传统上,化疗一直是癌症治疗的主要手段,但化疗药物的获得性耐药性阻碍了临床应用并导致疾病复发。后来开发出激酶抑制剂,免疫疗法也暴露了耐药性的问题。由于PROTAC通过清除整个靶蛋白来影响蛋白功能,包括酶促活性功能和非酶促功能,因此该技术有望解决当前治疗面临的潜在耐药性。

其次,PROTACs有潜力瞄准“不可成药的目标”。大多数小分子药物或大分子抗体需要与酶或受体的活性位点结合才能发挥作用;然而,据估计,人体细胞中 80% 的蛋白质都缺乏这样的位点。 PROTAC 可以通过任何角落和缝隙抓住目标蛋白质。

第三,PROTACs可以影响非酶功能。传统的小分子药物通常通过消除其靶标的酶活性来发挥作用。越来越多的研究表明,PROTACs具有扩大靶点“可成药空间”并控制蛋白酶和非酶功能的潜力。

PROTAC的发展概述

PROTAC 与其他治疗技术的比较
(来源:信号转导和靶向治疗)

Arivinas由Craig Crews创立,进PROTAC技术的药物开发近两年, Arivinas公司开发的针对雄激素受体(AR)的PROTAC抑制剂ARV-110和针对雌激素受体(ER)的PROTAC抑制剂ARV-471在前列腺癌和乳腺癌中得到了临床验证,分别是PROTAC技术应用的里程碑。

PROTACs的临床试验研究

除了作为研究工具外,PROTAC 在疾病治疗方面也具有巨大的应用潜力。它已成为一种新的药物发现模式,有潜力将传统药物发现转变为新的重磅疗法。截至2022年3月,如下表所示,全球已有十余种PROTAC药物进入临床开发阶段。其中Arvinas的ARV-110和ARV-471已进入临床II期,是PROTAC药物中临床进展最快的。

PROTAC的发展概述

表1. 全球临床和IND阶段基于PROTAC技术的蛋白降解候选药物汇总
(Signal Transduct Target Ther, 7(1): 181.)

结论

与其他药物和疗法相比,PROTACs具有许多潜在的优势,例如广泛的组织分布和口服给药。与其他疗法(如细胞疗法、抗体药物等)相比,PROTAC的生产工艺更为简单。与小分子药物相比,PROTAC可以靶向更多小分子药物无法靶向的靶点,从而产生更好的疗效。因此,PROTAC技术受到业界高度关注,并开始应用于癌症、免疫紊乱、病毒感染、神经退行性疾病等药物研发,其中以癌症领域的应用为主一。由克雷格·克鲁斯 (Craig Crews) 创立的阿里维纳斯 (Arivinas) 是第一个推出该药物的公司PROTAC技术的发展。近两年,Arivinas公司开发的针对雄激素受体(AR)的PROTAC抑制剂ARV-110和针对雌激素受体(ER)的PROTAC抑制剂ARV-471在前列腺癌和乳腺癌中得到了临床验证,分别是PROTAC技术应用的里程碑。

尽管PROTAC在过去20年中发展迅速,但仍有许多挑战需要解决。这些挑战主要来自两个方面,即PROTAC分子设计和成药性的优化,以及生物活性的综合评价。第一个是关于 PROTAC 的分子设计和成药性,涉及靶蛋白配体、新的 E3 连接酶配体和新的接头。二是生物活性评价,涉及PROTAC分子的筛选、成药性评价和药理评价。这些问题目前还没有现成的答案,但相信随着更多生物学、药理学和临床研究的发展,新的评价方法和体系将逐步建立来解决这些问题。相信未来会有越来越多的PROTAC进入临床前和临床研究,这将进一步测试PROTACs的治疗效果。预计未来PROTAC技术将为人类疾病治疗和生命健康带来裨益。

PROTAC 开发中常用的接头是 PEG。Biopharma PEG是一家专业的PEG衍生物供应商,提供多功能PEG衍生物作为PROTAC连接体。我们拥有 3000 多种高纯度PEG 连接体库存,为客户的制药和生物技术研发领域的聚乙二醇化、生物共轭、ADC 药物开发提供支持。