巨型病毒:它们能制造蛋白质吗?
美国能源部联合基因组研究所的科学家通过分析奥地利克洛斯特新堡废水处理厂样本的宏基因组数据,发现了四种新的巨型病毒 (1)。这些被称为“ Klosneuviruses “的病毒拥有比迄今为止已知的任何其他病毒更完整的翻译机器基因。例如,克洛斯新病毒包含对20 个氨基酸中的 19个具有特异性的氨酰基-tRNA(转移核糖核酸)酶基因,以及超过 20 个 tRNA、一系列翻译因子 和 tRNA 修饰酶。
该论文的合著者、美国国立卫生研究院的进化和计算生物学家尤金·库宁博士表示,“由于蛋白质合成是细胞生命最显着的标志之一,这表明这些新病毒更像是‘细胞’”。 -比任何人以前见过的任何病毒都像”(2)。
有趣的是,2016 年,Koonin 和 Konstantin Severinov 的团队描述了一种巨大的转导芽孢杆菌噬菌体,它仅依赖于两个多亚基病毒 RNA 聚合酶 (RNAP) 来独立于宿主转录来转录其基因组 (3)。病毒基因组转录仅由病毒 RNA 聚合酶进行的情况极为罕见,因为大多数病毒利用宿主生物体的多亚基 RNA 聚合酶 (RNAP) 来转录其基因。
在 2003 年发现第一个巨型病毒 (4) 之前,传统观点认为病毒本身无法合成 DNA、RNA 或蛋白质,因为它们太小并且必须依赖宿主细胞的机制。从那时起,更多的巨型病毒被报道出来,更多的研究挑战了一些旧的教条,揭示了病毒具有与细胞生物相当的遗传、蛋白质组和结构复杂性。
虽然病毒没有自己的核糖体,但几乎完整的翻译组件集的存在令人着迷,并引发了许多问题。 如果病毒在不劫持宿主细胞核糖体的情况下无法制造蛋白质,那么为什么它们需要拥有所有这些与翻译相关的基因?巨型病毒的大部分基因功能仍然未知,但也许有一天我们可以证实病毒可以自己制造蛋白质或肽!
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