bellbrooklabs: DNA损伤反应介绍

bellbrooklabs: DNA损伤反应介绍

DNA损伤反应途径

DNA损伤反应检测由复制错误或外部因素引起的DNA损伤,并动员蛋白质进行修复。DNA损伤反应蛋白包括:

DNA-PK-感知双链断裂(DSB)

PARP1与DSBs结合并形成聚ADP核糖(PAR)

PARG-DNA修复后移除PAR

DSB修复中的POLQ – DNA修饰酶

WRN——DSB修复中的DNA修饰酶

DNA损伤反应过程中会发生什么? 在DNA损伤反应(DDR)途径中,发生了一系列信号事件,包括DNA损伤检测、细胞周期停滞以促进修复和DNA修复途径的激活(同源重组、非同源末端连接等)。).如果损伤不可修复,DNA损伤要么被修复,要么发生细胞凋亡。

某些DNA损伤反应蛋白负责检测DNA损伤和促进下游DNA修复机制。共济失调-毛细血管扩张症突变型(异步传输模式)在响应DNA双链断裂(DSBs)时激活,并磷酸化下游靶标以启动DNA损伤修复。依赖DNA的蛋白激酶(DNA-PK)也参与DNA DSBs的识别并启动修复机制。ATM和Rad3相关((同antitransmit-receive)反收发)在应对单链断裂和停滞的复制分叉时激活,在应对DNA复制压力中发挥重要作用。  各种传感器、信号和效应蛋白参与不同种类的DNA损伤。DNA中的单链断裂可以通过碱基切除修复(BER)、核苷酸切除修复(NER)或错配修复(MMR)来修复。双链断裂是最严重的DNA损伤类型,通常通过同源重组或非同源末端连接(NHEF)来修复。

DNA损伤反应蛋白

双链断裂(DSB)是一种严重的DNA损伤形式,它由各种来源引起,如电离辐射或化学物质。在识别出DSB后,DNA-PK通过非同源末端连接(NHEJ)与断裂末端结合并协调下游DNA损伤修复机制。对争端解决机构的承认DNA-PK也被证明能激活I型干扰素反应。DNA-PK其作用类似于模式识别受体(PRR),通过识别DSB然后触发或改变炎症反应。

DNA损伤反应和先天免疫

DDR途径和先天免疫途径之间存在广泛的相互影响。在这里,DNA损伤剂在肿瘤细胞核中诱导DDR。dsDNA在细胞质中由细胞核或微核泄漏的DNA形成。PRRs对dsDNA的检测伴随着先天免疫反应,诱导I型干扰素和促炎细胞因子。在细胞外,腺苷(ADO)和cGAMP调节先天免疫反应;两者的水平都由胞外核苷酸酶控制。

合成致命性和癌症治疗

合成致命性是指两个基因一起出现是致命的,但这些基因单独出现是不致命的。将合成致死策略用于抗癌药物治疗已经显示出巨大的前景:DDR基因缺陷的肿瘤可以通过靶向第二种DDR蛋白的药物被选择性杀死。的使用喇叭声卵巢肿瘤抑制剂BRCA一号突变是这种方法的第一个临床实例。最近,POLQ被发现在常见肿瘤中具有合成致死性BRCA和异步传输模式突变,为PARPi耐药肿瘤提供了一种替代治疗策略。

DNA损伤反应分析

DNA损伤反应分析在研究DNA损伤反应蛋白和开发具有巨大疾病治疗潜力的途径小分子调节剂方面发挥着至关重要的作用。在贝尔布鲁克,我们开发并商业化了现成的DDR蛋白检测方法,这将加快研究人员发现这些调节剂的努力。  我们专注于为难以获得酶或开发检测方法的更难对付的酶目标创建完整的检测解决方案,以便您可以专注于优化先导分子。我们还为那些不想在内部进行分析的人提供线索发现和分析开发服务。通过我们的服务,您将直接与我们的科学家合作,他们是DDR途径的专家。我们的服务提供快速的周转时间、定制的检测条件和丰富的专业知识。

抗原修复技术技巧有哪些?

抗原修复技术技巧有哪些?

对于特定抗体,我应该使用哪种抗原修复方法

一些公司测试其抗体的免疫组织化学应用,并将在数据表中包含建议的 抗原修复方法(注意:一些建议的方法不是最佳的)。如果以上都没有给您明确的答案,则需要进行测试。

 

如何使用各种抗原修复方法对新抗体进行测试

最初,您可能想要测试 HIER 中的两种方法,例如 柠檬酸盐缓冲液 (pH 6)和 Tris-EDTA (pH 9),以及 PIER 中的一种或两种方法,例如 蛋白酶 K和/或 胰蛋白酶。这应该会给您一个很好的机会获得特定抗体的最佳抗体。

 

我用各种抗原修复方法测试了我的抗体 ,但仍然没有结果

该抗体可能不适合福尔马林固定、石蜡包埋的组织(某些抗体仅适用于冰冻切片),或者该抗体有问题(过期或损坏),您可能需要改用其他抗体。

 

在热诱导表位修复 (HIER) 方法中,哪一种比较好

柠檬酸盐缓冲液(pH 6)法是常用的方法之一。一些研究表明 Tris-EDTA (pH 9)或 Tris-HCl (pH 10) 更佳。测试可能是了解哪种抗体适合特定抗体的最佳方法。

 

使用HIER进行预处理时需要考虑哪些关键因素

(1) 修复液温度应在95℃左右。

(2)孵育时间至少10分钟,一般20分钟左右。

(3) 修复液的pH值取决于您所使用的溶液。

 

在蛋白水解酶诱导表位修复 (PIER) 方法中,哪一种比较好

蛋白酶 K似乎是常用的一种。浓度、孵育时间和温度可能是需要考虑的更重要的因素。同样,测试是了解哪种抗体适合特定抗体的最佳方法。

 

使用PIER进行预处理时需要考虑哪些关键因素

(1) 酶的浓度通常为 0.05-0.1%,具体取决于组织和固定的类型。

(2)孵育时间可为5-30分钟,常用10-15分钟。

(3)孵化温度通常为37 

 

冰冻切片是否需要进行抗原修复:新鲜冰冻切片的免疫染色不需要进行抗原修复。因为抗原修复是破坏福尔马林固定形成的交联,将新鲜冰冻切片切片并用冰冷的丙酮固定5-10分钟。