同仁化学代谢 糖代谢 脂质代谢 线粒体呼吸 氨基酸代谢| 日本DOJINDO

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代谢

细胞内代谢系统(糖酵解系统,TCA回路和电子转移系统)的分析对于理解细胞状态非常重要。
糖代谢
脂质代谢
线粒体呼吸
氨基酸代谢

品名货号用途

Glycolysis/JC-1 MitoMP Assay Kit G272 糖酵解(乳酸生成量)和线粒体膜电位(JC-1)同时检测
糖酵解/氧化磷酸化检测试剂盒—Glycolysis/OXPHOS Assay Kit G270 方便快捷的检测糖酵解能、细胞代谢途径转移、细胞对糖酵解途径和氧化磷酸化途径的依赖程度
Glucose(葡萄糖)摄取能力检测试剂盒-Blue UP01 葡萄糖摄取能力检测(蓝色荧光)
Glucose(葡萄糖)摄取能力检测试剂盒-Green UP02 葡萄糖摄取能力检测(绿色荧光)
Glucose(葡萄糖)摄取能力检测试剂盒-Red UP03 葡萄糖摄取能力检测(红色荧光)
Glucose Assay Kit-WST试剂盒 G264 葡萄糖含量检测
Lactate Assay Kit-WST试剂盒 L256 乳酸检测试剂盒
α-Ketoglutarate Assay Kit-Fluorometric K261 对细胞内的α-KG进行定量检测

脂肪酸摄取测定试剂盒——Fatty Acid Uptake Assay Kit UP07 脂肪酸摄取检测
Lipi-Blue试剂 LD01 脂滴检测(蓝色)
Lipi-Green试剂 LD02 脂滴检测(绿色)
Lipi-Red试剂 LD03 脂滴检测(红色)
Lipi-Deep Red试剂 LD04 脂滴检测(深红色)
Lipid Droplet Assay Kit-Blue试剂 LD05 脂滴荧光检测(蓝色)
Lipid Droplet Assay Kit-Deep Red试剂 LD06 脂滴荧光检测(深红色)
ADP/ATP比率检测试剂盒—ADP/ATP Ratio Assay Kit-Luminescence A552 检测细胞中ADP与ATP的比率
Oxygen Consumption Rate(OCR) Plate Assay Kit-氧消耗量检测试剂盒 E297 氧消耗量检测
Cell Counting Kit-Luminescence试剂盒 CK18 ATP活性检测
Glutamine Assay Kit-WST试剂盒 G268 谷氨酰胺的定量检测
Glutamate Assay Kit-WST试剂盒 G269 谷氨酸的定量检测
NAD/NADH Assay Kit-WST试剂盒 N509 NAD/NADH检测试剂盒
NADP/NADPH Assay Kit-WST试剂盒 N510 NADP/NADPH检测
氨基酸摄取能力检测试剂盒——Amino Acid Uptake Assay Kit UP04 检测细胞摄取氨基酸的能力
胱氨酸摄取能力检测试剂盒—Cystine Uptake Assay Kit UP05 胱氨酸摄取能力检测

各项代谢指标完全解读

糖酵解氧化磷酸化代谢关联指标

脂质代谢关联指标

氨基酸代谢关联指标

线粒体相关指标

衰老相关指标

 

当试图了解细胞状态时,分析各种细胞内代谢途径【例如糖酵解系统、三羧酸(TCA)循环、电子运输链等】非常重要。代谢产物和能量来源,【例如葡萄糖、乳酸和NAD(P)+/NAD(P)H】都是用于分析细胞内代谢的指标。

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细胞代谢与疾病

近年来,针对癌症、糖尿病等疾病模型的细胞内代谢研究受到了广泛关注。下面是不同疾病的 代谢指标变化的详细介绍。

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癌症

癌细胞在无限增殖的同时保持着活跃的细胞代谢,不断吸收大量的营养物质进行蛋白质、核酸、能量(如ATP)的合成。即使在不利的环境下(低氧气、低营养),癌细胞仍然可以通过改变代谢途径而存活下来。近年来,针对癌细胞的代谢途径的研究也越来越多。

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糖代谢有两种途径:线粒体氧化磷酸化和糖酵解(Glycolysis)。正常哺乳动物细胞在有氧条件下,糖酵解被抑制。而癌细胞即使在氧气充足的情况下,糖酵解仍然十分活跃(瓦格博效应,Warburg effect)。因此,癌细胞大量的摄取糖分并在亢进的糖酵解作用下大量产生乳酸。由于糖酵解途径在生成ATP时并不需要氧气,所以即使在低氧环境下,癌细胞仍然可以增殖。另一方面,癌细胞的线粒体利用氨基酸和脂肪产生NADH,NADH除了用于产生ATP以外,还主要用于抵御氧化还原作用。癌细胞的线粒体有着异常的机能,这会引起线粒体膜电位的上升(过极化)以及过剩的活性氧的产生。因此需要产生大量的谷胱甘肽来维持胞内的氧化还原平衡。而谷氨酰胺 (Glutamine)和胱氨酸(Cystine)是谷胱甘肽合成的必要来源,癌细胞不断的过量摄入这些氨基酸。另外,由于需要 NADPH来维持还原型谷胱甘肽,癌细胞会不断利用从糖酵解、戊糖磷酸途径(pentose phosphate pathway)以及线粒体产生的NADH来维持高浓度的NADPH。

*请注意,上述内容是概括性的癌细胞代谢特征的描述。随着癌细胞种类的不同和环境的变化会有一定差别。

参考文献

下面是一些癌细胞代谢的综述性文献,供初次接触这一领域的研究人员参考。

1) 糖酵解:M. G. Vander Heiden, L. C. Cantley, and C. B. Thompson, “Understanding the Warburg Effect: The Metabolic Requirements of Cell Proliferation”, Science, 2009, 324, 1029.

2) 氨基酸代谢、ROS:P. Koppula, Y. Zhang, and B. Gan, “Amino Acid Transporter SLC7A11/xCT at the Crossroads of Regulating Redox Homeostasis and Nutrient Dependency of Cancer”, Cancer Commun., 2018, 38, 12.

3) 氨基酸代谢:E. L. Lieu, T. Nguyen, S. Rhyne, and J. Kim, “Amino Acids in Cancer”, Exp. Mol. Med., 2020, 52, 15.

4) 线粒体、ROS、NADPH:F. Ciccarese and V. Ciminale, “Escaping Death: Mitochondrial Redox Homeostasis in Cancer Cells”, Front. Oncol. 2017, 7, 117.

5) NADH:A. Chiarugi, C. Dolle, R. Felici, and M. Ziegler, “The NAD Metabolome-A Key Determinant of Cancer Cell Biology”, Nat. Rev. Cancer, 2012, 12, 741.

⚫ 葡萄糖(Glucose)代谢障碍与抗癌作用

⚫ 氨基酸代谢障碍和抗癌作用

⚫ 1个试剂盒,匀浆和非匀浆自由选择

⚫ 癌细胞免疫与代谢

抑制葡萄糖代谢和抗癌作用

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癌细胞主要使用糖酵解系统产生ATP,因此针对糖酵解系统的抗癌药物的开发已经进行了很长时间。目前还没有开发出有效的抗癌药物,但糖酵解仍然是癌细胞的主要药物靶点。因此,糖酵解是了解癌细胞代谢的最重要途径。

葡萄糖转运蛋白(GLUT)是药物发现中糖酵解靶蛋白的一个例子。由于癌细胞通过葡萄糖转运蛋白摄取大量的糖,因此可以通过直接抑制葡萄糖转运蛋白来抑制糖酵解。另外,抑制葡萄糖饥饿的活性、糖酵解系统的酶 (己激酶:HK、乳酸脱氢酶:LDH等) ,和抑制糖酵解系统的最终产物乳酸向细胞外的流出也是有效的手段。

各抑制剂引起的细胞内代谢变化.文献

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产品用途 产品名称
货号
葡萄糖检测试剂盒 Glucose Assay Kit-WST G264
乳酸检测试剂盒 Lactate Assay Kit-WST L256
NAD/NADH 检测试剂盒 NAD/NADH Assay Kit-WST N509
NADP/NADPH 检测试剂盒 NADP/NADPH Assay Kit-WST N510
JC-1 线粒体膜电位检测试剂盒 JC-1 MitoMP Detection Kit MT09

 

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抑制氨基酸代谢与癌症治疗

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在增殖活跃的癌细胞中,氨基酸是蛋白质和核酸合成所必需的营养素。由于癌细胞中来自糖酵解系统的乙酰CoA的供给降低,因此积极利用氨基酸

作为TCA循环的营养源。研究表明,癌细胞通过氨基酸转运蛋白的表达量增加,吸收大量氨基酸。特别是谷氨酰胺是谷胱甘肽的原料和TCA循环中必需的α-酮戊二酸的来源,并且针对谷氨酰胺的摄取和代谢(谷氨酰胺分解)的药物开发备受关注。此外,我们发现与许多必需氨基酸摄取有关的氨基酸转运蛋白LAT(L-type amino acid transporter)在许多癌细胞中过度表达,并有望作为新的药物发现目标。
与其他氨基酸不同,氧化还原控制所需的半胱氨酸主要由胱氨酸转运蛋白xCT吸收到细胞中。癌细胞会产生大量的活性氧,从而增加抗氧化剂谷胱甘肽的产生,维持氧化还原平衡。因此,通过抑制谷胱甘肽产生的途径,可以改变细胞内氧化还原平衡,并诱导细胞死亡,如铁吞作用。此外,谷胱甘肽还有助于耐药性,因此涉及谷胱甘肽产生的途径是药物发展的主要目标。特别是最近,长期用作抗炎药的磺胺沙拉嗪和癌症的分子靶向治疗药物索拉非尼布抑制了xCT,通过xCT抑制的铁吞作用引起了人们的关注。

各抑制剂引起的细胞内代谢变化.文献

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关联产品

 

产品用途 产品名称
货号
NAD/NADH 检测试剂盒 NAD/NADH Assay Kit-WST N509
JC-1 线粒体膜电位检测试剂盒 JC-1 MitoMP Detection Kit MT09
谷氨酰胺检测试剂盒 Glutamine Assay Kit-WST G268
谷氨酸检测试剂盒 Glutamate Assay Kit-WST G269
GSSG/GSH检测试剂盒 GSSG/GSH Quantification Kit G263
脂质过氧化物检测试剂 Liperfluo L248
线粒体过氧化物检测试剂 MitoPeDPP M466
自噬检测试剂 DAPGreen – Autophagy Detection D676

抑制脂肪酸代谢和抗癌作用

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细胞增殖活跃的癌细胞当然需要大量的脂质。因此,细胞内的脂肪酸合成和细胞外的脂肪酸摄取是很活跃的。因此,许多癌细胞增加了脂质滴的积累。针对癌细胞的治疗目标主要是与脂肪酸的产生相关的途径,并开发了许多抑制剂。

另一方面,癌细胞利用脂肪酸的β氧化来有效地产生能量,以补充糖酵解系统低效能量的产生。因此,以脂肪酸的β氧化为目标的药剂开发也在进行中。

各抑制剂引起的细胞内代谢变化.文献

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关联产品

 

产品用途 产品名称
货号
脂滴检测试剂盒  Lipid Droplet Assay Kit

– Blue/Deep Red

LD05/LD06
脂滴荧光染料 Lipi-Blue/Green/Red/Deep Red LD01/LD02/LD03/LD04
NADP/NADPH 检测试剂盒 NADP/NADPH Assay Kit-WST  N510
GSSG/GSH检测试剂盒 GSSG/GSH Quantification Kit G263

癌症免疫治疗与细胞代谢

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T细胞在消除癌细胞的免疫系统中起着核心的作用。近年来发现,T细胞的分化和活化等调节机制也与细胞内的代谢有关,因此癌症免疫相关的代谢研究也越发活跃起来。癌细胞需要吸收大量营养才能维持增殖活性,而活化的T细胞同样需要大量营养(尤其是葡萄糖)才能消除癌细胞。所以,活化的T细胞与癌细胞存在局部的“葡萄糖竞争”。众所周知,癌细胞可以通过表达活性化T细胞表面的免疫检查点PD-1来抑制T细胞的活性。而且,最近的研究发现,在这个相互作用中,T细胞的葡萄糖摄取也会受到抑制。癌细胞通过抑制免疫细胞的代谢来获得免疫逃逸,因此癌症免疫方面的研究并不局限于癌细胞,对免疫细胞的代谢研究也十分重要。

参考文献 

1) Z. Yin, L. Bai, W. Li, T. Zheng, H. Tian, and J. Cui, “Targeting T cell metabolism in the tumor microenvironment: an anti-cancer therapeutic stratety”, J. Exp. Clin. Cancer Res. 2019, 38, 403.

2) L. Almeida, M. Lochner, L. Berod, and T. Sparwasser, “Metabolic pathways in T cell activation and linear differentiation”, Semin. Immunol. 2016, 28(5), 514.

3) A. Kumar and K. Chamoto, “Immune metabolism in PD-1 blockage-based cancer immunotherapy”, Int. Immunol., 2020 Jul 5;dxaa046.

4) D. G. Franchina, F. He, and D. Brenner, “Survival of the fittest: Cancer challenges T cell metabolism”, Cancer Lett., 2018, 412, 216.

5) N. Patsoukis, K. Bardhan, P. Chatterjee, D. Sari, B. Liu, L. N. Bell, E. D. Karoly, G. J. Freeman, V. Petkova, P. Seth, L. Li, and V. A. Boussiotis, “PD-1 alters T-cell metabolic reprogramming by inhibiting glycolysis and promoting lipolysis and fatty acid oxidation”, Nat. Commun., 2015, 6, 6692.

各抑制剂引起的细胞内代谢变化.文献

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关联产品

 

产品用途 产品名称
货号
葡萄糖检测试剂盒 Glucose Assay Kit-WST G264
乳酸检测试剂盒 Lactate Assay Kit-WST L256
谷氨酰胺检测试剂盒 Glutamine Assay Kit-WST G268
谷氨酸检测试剂盒 Glutamate Assay Kit-WST G269

糖尿病

抑制葡萄糖代谢和抗癌作用

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在高血糖状态下,细胞内葡萄糖浓度升高,多元醇途径代谢增强。这会过 度消耗NADPH,减少还原型谷胱甘肽(GSH)。 其结果是,氧化应激增加,促进细胞损伤。

参考文献 

M. Brownlee, “The pathobiology of diabetic complications: a unifying mechanism”, DIABETES, 2005, 54, 1615.

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产品用途 产品名称
货号
NAD/NADH检测试剂盒  NAD/NADH Assay Kit-WST N509
NADP/NADPH 检测试剂盒 NADP/NADPH Assay Kit-WST N510
谷胱甘肽检测试剂盒 GSSG/GSH Quantification Kit G263

衰老

 

⚫ 衰老相关疾病与乳酸、NAD+的关系

⚫ DNA损伤引发的细胞衰老

⚫ 谷氨酰胺代谢与细胞衰老

衰老相关疾病与乳酸、NAD +的关系

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近年来,NAD+与衰老之间的关系 引起了人们的关注。单个小鼠的 衰老模型中,在肝脏等中观察到 的NAD+量减少1),并且据报道, 抑制NAD +合成酶会导致衰老细胞 功能下降2)。此外,NAD+量的减 少导致线粒体功能下降3),而线粒 体功能的降低表明NAD+量减少, 从而导致衰老细胞的功能下降4)。

DNA损伤引发的细胞衰老

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在衰老的细胞中,由于线粒体功能下 降,主要由厌氧的糖酵解通路产生ATP, 因此乳酸的产生量增加7)。 DNA损伤是细胞衰老导致线粒体功能 障碍的原因之一。 DNA损伤的积累会激活 DNA修复机制并增加NAD+消耗。 NAD+量的减少会降低SIRT1活性,这 是维持线粒体功能的重要因素,导致线粒 体功能的降低(电子转移的抑制→ATP产 生/ NAD+量的减少)3),8)。

谷氨酰胺代谢和细胞衰老

抑制肿瘤的menin通过靶向依赖mTORC1的代谢激活来预防效应CD8T细胞功能障碍9)。

Menin是一种肿瘤抑制因子,在预防衰老和疲劳等T细胞功能障碍中起着重要作用。当Menin缺乏时, mTORC1被激活,并通过糖酵解系统和谷氨酰胺降解增强氧化磷酸化,导致CD8T细胞功能障碍。此外, 谷氨酰胺代谢中间产物α酮戊二酸有助于维持mTORC1激活和促进细胞衰老(SA-β-gal活性增强)。谷氨酰 胺-α-酮戊二酸通路在诱导CD8T细胞功能障碍中发挥重要作用,并发现Menin有抑制T细胞衰老的可能性。

代谢 糖代谢 脂质代谢 线粒体呼吸 氨基酸代谢

关联产品

 

产品用途 产品名称
货号
细胞衰老检测试剂盒 (荧光显微镜 / 流式细胞仪用)  Cellular Senescence Detection Kit – SPiDER-βGal SG03
细胞衰老检测试剂盒 (荧光酶标仪用) Cellular Senescence Plate Assay Kit – SPiDER-βGal SG05
JC-1 线粒体膜电位检测试剂盒  JC-1 MitoMP Detection Kit MT09

代谢组学相关数据库(及常用软件)

代谢组学相关数据库(及常用软件)

常用的代谢组相关数据库包括人类代谢组数据库(HMDB)、KEGG数据库、Reactome数据库等,介绍如下: 人类代谢组数据库(HMDB)是代谢组学中比较流行的数据库之一,包括人类小分子的详细信息体内发现的分子代谢物,不少于79,650个代谢物条目。 SMPDB 数据库与 HMDB 链接,包含大约 700 条人类代谢和疾病途径的途径图。 KEGG数据库是流行的代谢组数据库之一,包含代谢途径和相互作用网络的信息。 Reactome数据库主要收集人体主要代谢途径和重要反应的信息。 MassBank数据库主要收集许多高分辨率低代谢成分的光谱。

BioCyc 数据库包含途径和基因组数据。 METLIN 数据库是一个商业代谢组和串联质谱数据库,包含约 43,000 种代谢物和 22,000 个 MS/MS 谱图。 FiehnLib 数据库是一个商业代谢组数据库,包含约 1000 个保守代谢物的 EI 谱。

NIST/EPA/NIH 质谱库数据库也是一个商业代谢组数据库,包含超过 190,000 个 EI 谱图。 BioCyc 数据库收集途径和基因组数据,并且免费提供。 MetaCyc 数据库全面收集了许多不同生物体的代谢途径和酶的信息,包括 51,000 多篇文章。 MMCD数据库收集了10,000多种代谢物的信息及其MS和NMR数据,其中大部分是拟南芥代谢物。

代谢组学的分析流程

代谢组学的分析流程

一般来说,代谢组分析流程如下:首先对代谢物进行预处理,预处理的方法由测量分析方法决定。如果采用质谱分析,则需要提前将代谢物分离并电离。然后对预处理后的组分进行定性和定量分析。

在预处理中,常用的分离方法包括:气相色谱法(GC)、高效液相色谱法(HPLC)。气相色谱分辨率较高,但需要代谢组分气化,对组分的分子量有一定限制。高效液相色谱也广泛应用于代谢组分析,因为它在液相中分离代谢成分,因此不需要气化成分。与气相色谱法相比,其测量范围更宽,灵敏度更高。优势。此外,毛细管电泳还可以分离代谢成分,应用较少,但理论上其分离效率高于高效液相色谱。

在预处理过程中,常常会添加内标,以方便后续对样品质量的监测和比较。由于不同的实验批次和进样顺序对后续测量也有一定的影响,因此还添加了空白对照。与混合样品进行比较以进行质量监控。

对不同代谢成分进行定性和定量分析的方法包括质谱法(Massspectrometry,MS)和核磁共振波谱法(NuclearMagneticResonanceImaging,NMR)。其中,质谱法具有灵敏度高、特异性强的优点,广泛应用于代谢物的检测。它可以对分离和电离后的代谢物进行定性和定量。电离方法包括:常压化学电离(Atmospheric-Pressure Chemical Ionization,APCI)、电子电离(Electron ionization,EI)、电喷雾电离(Electrospray ionization,ESI)等,需要根据不同的分离方法进行选择。例如,电喷雾电离通常用于通过液相色谱分离组分。然而,由于质谱法不能直接检测生物溶液或组织,其应用受到了限制。为了提高原有质谱分析的灵敏度、简化样品制备、减少背景的影响,一些新的质谱相关技术得到了发展。这些技术包括:二次离子质谱 (SIMS) 和纳米结构引发剂 MS (NIMS),它们都是解吸/电离方法,两者均与基质无关。其中,SIMS利用高能离子束解吸样品的接触表面,具有空间分辨率高的优势,是与质谱联用的器官/组织成像的强大技术。 NIMS可用于小分子的检测。基质辅助激光解吸/电离(MALDI)是一种较为温和的电离方法,可以获得一些常规电离方法容易解离成片段的完整大分子的质谱信息,如DNA、蛋白质、肽和糖等。解吸电喷雾电离 (DESI) 是一种直接电离技术,可与质谱法串联使用,在大气条件下直接分析样品。其原理是利用快速移动的带电溶液流从接触表面提取样品,可用于法医分析、药物、植物、生物组织、聚合物等的分析。激光烧蚀电喷雾电离(LAESI)是一种结合中红外激光烧蚀和二次电喷雾电离的直接电离技术,可用于多种样品,包括植物、组织、细胞,甚至血液、尿液等未经处理的生物溶液,已应用于食品监管、药品监管等领域。核磁共振波谱不需要预先分离代谢组分。与质谱分析相比,核磁共振波谱具有结果重现性更好、样品制备更简单、无需预分离、对样品破坏较小等优点。它低于质谱法(有争议,一些人认为这是由于样品预处理工作流程不正确),但由于其易用性也被广泛使用。药品监管等领域。核磁共振波谱不需要预先分离代谢组分。与质谱分析相比,核磁共振波谱具有结果重现性更好、样品制备更简单、无需预分离、对样品破坏较小等优点。它低于质谱法(有争议,一些人认为这是由于样品预处理工作流程不正确),但由于其易用性也被广泛使用。药品监管等领域。核磁共振波谱不需要预先分离代谢组分。与质谱分析相比,核磁共振波谱具有结果重现性更好、样品制备更简单、无需预分离、对样品破坏较小等优点。它低于质谱法(有争议,一些人认为这是由于样品预处理工作流程不正确),但由于其易用性也被广泛使用。有些人认为这是由于样本预处理工作流程不正确造成的),但由于其易用性,它也被广泛使用。有些人认为这是由于样本预处理工作流程不正确造成的),但由于其易用性,它也被广泛使用。

此外,其他检测方法还包括:离子迁移谱分析(Ion-mobilityspectrometry,IMS)是一种基于电离分子在气相载体中的迁移来分离和分析这些分子的技术。灵敏度高,可单独使用或与质谱、气相色谱或液相色谱串联使用。电化学检测技术与高效液相色谱 (HPLC-ECD) 相结合,可用于测量复杂基质中的低含量成分,具有易用性、灵敏度和选择性。应用于临床研究、食品检测、药物检测等领域。拉曼光谱基于振动光谱,可以检测化合物的结构及其微小变化。具有不破坏样品、样品前处理简单、和高空间分辨率。它已用于临床病理学研究和微生物分类。以及检测、化合物分析等领域。

代谢组学数据的统计分析方法和策略

代谢组学数据的统计分析方法和策略

代谢组学数据的统计分析方法和策略

获得代谢组学数据后,需要利用软件读取并分析原始数据的信息,以确定原始数据中所含代谢成分的组成和含量。有许多统计软件可以读取和分析核磁共振谱和质谱数据。 XCMS 是一款常用的免费软件,用于读取和分析质谱原始数据。类似的常用软件还有MZmine2、MetAlign、MathDAMP、LCMStats等。

一旦获得代谢物组成和含量,就可以对这些数据进行统计分析。常用的分析方法包括主成分分析(PCA)、偏最小二乘回归、聚类分析、差异表达分析等。结果还可以利用上述数据库进行功能和通路富集分析。

代谢组学与组学数据整合

代谢组学与其他组学数据整合

如何更好地整合各种组学数据仍然是生物界面临的重大挑战,有时还面临不完善的实验设计和不同实验平台数据的整合。常用的方法有代谢途径水平分析、生物网络分析、经验相关分析等。有些软件或网站提供整合多个组学数据的即用型分析。例如,代谢途径富集分析包括:IMPaLA网站,使用来自11个数据库的3000多个代谢途径的信息,可用于整合多个组学分析;另外还有iPEAP软件、MetaboAnalyst网站等,可以提供代谢途径富集分析。提供生物网络分析包括:SAMNetWeb网站、可提供腹肌通路分析以及转录组和蛋白质组的网络分析; pwOmics包,是一个R软件包,可以根据随时间变化的转录组和蛋白质组信息构建网络;类似的软件还有MetaMapR(R包,带用户界面)、MetScape(Cytoscape插件)、Grinn(R包)等。可以进行经验相关性分析:WGCNA(R软件包),可以基于相关性和网络拓扑来整合和分析多种组学数据;其他 R 软件包包括 MixOmic、DiffCorr、qpgraph 和巨大。类似的软件还有MetaMapR(R包,带用户界面)、MetScape(Cytoscape插件)、Grinn(R包)等。可以进行经验相关性分析:WGCNA(R软件包),可以基于相关性和网络拓扑来整合和分析多种组学数据;其他 R 软件包包括 MixOmic、DiffCorr、qpgraph 和巨大。类似的软件还有MetaMapR(R包,带用户界面)、MetScape(Cytoscape插件)、Grinn(R包)等。可以进行经验相关性分析:WGCNA(R软件包),可以基于相关性和网络拓扑来整合和分析多种组学数据;其他 R 软件包包括 MixOmic、DiffCorr、qpgraph 和巨大。