KAPA 文库扩增试剂盒

KAPA Library Amplification Kits文库扩增试剂盒

KAPA 文库扩增试剂盒

罗氏测序解决方案推出的文库扩增方案,采用了KAPA HiFi DNA聚合酶,一种具有行业领先高保真和性能稳定的新型酶。这种新型酶改进了测序总体序列质量,具有低扩增偏差,低重复率和在困难区域更均匀的覆盖度。

罗氏提供的另一种聚合酶,KAPA HiFi Uracil+DNA聚合酶,保持高保真、高稳定性的特性外,还具有尿嘧啶耐受活性,从而适合应用于亚硫酸氢盐转化DNA的文库构建。

KAPA 文库扩增解决方案

高保真、低扩增偏差,适用于所有需要PCR的NGS工作流程。

更有效地扩增GC-rich和AT-rich片段和基因组

  • 改进对所有文库片段和序列区域的覆盖
  • 由于具有更高的扩增效率,仅需更少的循环数即可获得相等的产量
KAPA 文库扩增试剂盒
KAPA 文库扩增试剂盒

KAPA HiFi已成为NGS文库扩增的行业金标准。

使用N系列产品以及K系列产品扩增从相同打断的P. falciparum(19% GC)、C. difficile(28% GC)、E. coli(51% GC)和B. pertussis(68% GC)基因组DNA构建的文库。

(A) 与N相比,K更显著地均匀覆盖了C. difficile的基因组。
(B) 对于所有生物体的扩增效率,K的性能优于N,更少的扩增次数对关键测序指标有积极的影响。

提高测序覆盖度

  • 所有GC窗口的覆盖均匀度得到提升
KAPA 文库扩增试剂盒

KAPA HiFi HotStart ReadyMix降低扩增偏差,提高测序覆盖度。

使用产品K(左)或产品C(右),从100 ng Covaris打断的人类基因组DNA构建文库用作全基因组鸟枪法测序。使用K的扩增偏差更低,覆盖更均匀。数据由The Broad Institute提供 (Cambridge, MA, USA)。

行业领先的NGS文库扩增高保真度

  • 增强(3-5外切核酸酶)校对活性
KAPA 文库扩增试剂盒

焦磷酸测序确定了KAPA HiFi酶行业领先的高保真度。

Taq酶、基于Taq酶的长片段PCR预混液、具有校正功能的DNA聚合酶(产品N和产品T)的已发表错误率,与KAPA HiFi HotStart DNA聚合酶的错误率比较结果(每3.54×10-6个核苷酸掺入1个错误,由454平台深度测序验证)。相比而言,KAPA HiFi酶比Taq酶低50-100倍。

KAPA HiFi Uracil+ DNA 扩增酶

甲基化测序工作流程中准确、有效地扩增亚硫酸氢盐处理的DNA

高效扩增含尿嘧啶的模板

  • 来源于KAPA HiFi DNA聚合酶的尿嘧啶耐受的,具有校正功能的扩增酶
KAPA 文库扩增试剂盒

KAPA HiFi Uracil+ReadyMix不受dUTP抑制。

SYBR® Green法实时荧光定量PCR检测dUTP对PCR扩增的影响,结果显示dUTP可以抑制常规PCR反应液的扩增(左),而KAPA HiFi Uracil+ ReadyMix (右) 无扩增抑制(dUTP浓度为0.2 mM,扩增片段长度为452 bp,模板稀释比例为80 pM-0.8 fM)。

解锁亚硫酸氢盐转化文库构建的真正潜能

  • 通过更高的文库产量和更少的扩增循环数来降低PCR重复和偏差
  • 高扩增效率保证长片段文库构建质量
KAPA 文库扩增试剂盒

KAPA HiFi Uracil+ ReadyMix 提供更高的文库产量和最小的文库分子大小偏差。

使用12、14或16个循环的标准方案扩增人类全基因组亚硫酸氢盐处理的文库,并使用Bioanalyzer® 2100高灵敏度DNA检测系统分析扩增文库。与A相比,KAPA HiFi Uracil+ ReadyMix的产量更高 (左),片段大小偏差更小 (右)。

与DNA甲基化测序应用无缝连接

  • 高效扩增亚硫酸氢盐转化的文库
  • 改善亚硫酸氢盐测序read的质量
KAPA 文库扩增试剂盒
KAPA 文库扩增试剂盒

KAPA HiFi Uracil+ReadyMix成功扩增简化亚硫酸氢盐测序文库。

起始量为500 ng或10 ng的小鼠B细胞基因组DNA,经MspI消化后,使用KAPA HyperPrep Kit构建文库,及使用KAPA HiFi Uracil+ ReadyMix进行最后文库扩增。500 ng文库扩增10个循环,10 ng文库扩增15个循环。(A) 10 ng文库与500 ng文库(左)以及两次500文库之间(右)有着很好的相关性。(B)碱基组成与序列位置关系图显示,测序结果中>95%的reads都是以MspI切割位点(CCGG)开头。数据来自Emory University (Atlanta, GA, USA)。

MC-CN-00368 有效期至2021-12-31

仅供研究,不用于临床诊断。

相关应用

  • Amplification of Illumina libraries (DNA and RNA sequencing)
  • Pre- and post-capture amplification in targeted capture workflows
  • Real-time amplification of libraries prepared from low input, ChIP DNA and other precious samples

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产品手册

KAPA_Library Amplification Kit_TDS.pdf

规格明细 / 储存条件

Kits can be stored for up to 12 months at -20˚C.

Kits include KAPA HiFi HotStart ReadyMix (2X), a convenient PCR master mix containing KAPA HiFi HotStart DNA Polymerase, KAPA dNTPs, reaction buffer, and MgCl2 at a final concentration of 2.5 mM. Kits with primers are also available.

Kits for real-time library amplification include a real-time version of the KAPA HiFi HotStart ReadyMix, as well as fluorescent standards to monitor library amplification.

构成要素

KAPA 文库扩增试剂盒

规格明细

规格 描述
Compatible Platform Illumina HiSeq, MiSeq, NextSeq, and GAIIx
Library Type DNA, RNA, and bisulfite-treated DNA
Starting Material Any NGS library that requires amplification
Sequencing Applications Whole Genome Sequencing Whole Exome Sequencing Targeted Sequencing (custom panels) RNA-Seq ChIP-Seq Amplicon Sequencing/td>

Coming Soon!

订货信息

KAPA 文库扩增试剂盒(50 反应)

  • KK货号:KK2611
  • 产品货号:7958951001
  • 规格:50反应

KAPA 文库扩增试剂盒+引物(50 反应)

  • KK货号:KK2620
  • 产品货号:7958978001
  • 规格:50反应

KAPA 文库扩增试剂盒+引物(250 反应)

  • KK货号:KK2621
  • 产品货号:7958986001
  • 规格:250反应

KAPA 文库扩增引物(250 反应)

  • KK货号:KK2623
  • 产品货号:7958994001
  • 规格:250反应

KAPA 实时文库扩增试剂盒(250 反应)

  • KK货号:KK2702
  • 产品货号:7959028001
  • 规格:250反应

KAPA 文库定量试剂盒

KAPA文库定量试剂盒

KAPA 文库定量试剂盒

NGS文库制备完成后,在混合文库、上机测序之前,准确定量NGS文库,对于在最大程度上经济地使用测序仪的测序能力,非常重要。KAPA文库定量试剂盒为Illumina®及Ion TorrentTM平台的测序文库提供了可靠的,基于qPCR技术的定量方案。KAPA文库定量试剂盒包含了用于qPCR绝对定量的NGS文库扩增所需的所有试剂。包括KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix (为不同qPCR仪配置预混合液及预稀释的DNA标准品组。

产品特色

KAPA 文库定量试剂盒

  • 能可靠、灵敏地定量所有可被测序的文库分子
  • 能准确、可重复地定量不同浓度、不同片段长度分布、不同GC含量的文库文字
  • 对于多重测序,确保文库准确、等摩尔地混合
  • 工作流程灵活:即可支持手动,也可用于高通量的自动化平台

完整的文库定量方案

  • 无论是单种NGS文库,还是序列标签标注的多个文库池(library pool),qPCR绝对定量所需的所有试剂已经包含在试剂盒中
  • 标准曲线经过特殊设计,可适用于所有上游文库制备流程,包括PCR-free的文库制备流程
  • 仅定量可被测序的文库分子;对比qPCR方法,其他方法容易低估或者高估文库浓度
  • 可从KAPA网站或罗氏生命科学微信公众号获得数据分析模板与帮助
KAPA 文库定量试剂盒

KAPA文库定量试剂盒的工作原理。

qPCR的引物,根据平台特异性的文库街头(adaper)序列而设计,同时扩增6个预稀释的、组成浓度梯度的DNA标准品,以及稀释至合适浓度的待定量的NGS文库。将每个已知浓度DNA标准品的平均Cq值作图,生成标准曲线。标准曲线用于将稀释的待测NGS文库的平均Cq值转换为浓度,从而计算出待测文库的工作浓度。

KAPA 文库定量试剂盒
KAPA 文库定量试剂盒

qPCR能准确定量所有可测序分子。

(A)文库制备流程中,DNA插入片段和连接接头(adapter)会产生很多连接情况,除了两段皆连接上接头的可以被测序的文库文字,有一些连接情况(虚线框内)不支持后续的成簇扩增,不能被测序。qPCR能仅检测接头连接正确的分子,这对于PCR-free工作流程是特别关键的。分光光度法、荧光法及电泳法会检测所有的双链分子,无论接头的连接情况。(B)过度的文库扩增会导致引物消耗,随后的变性及退火过程会产生不完全退火的部分双链、部分单链的DNA异构体。采用dsDNA结合染料的电泳和荧光检测仅能检测完整的双链DNA片段,导致对过度扩增文库定量的低估。

基因工程改造的KAPA SYBR® FAST DNA聚合酶是高效文库定量的关键

  • KAPA SYBR FAST经基因工程改造从而对于不同长度、不同GC含量、不同浓度的DNA分子,能有相似的扩增效率
  • 对比之下,只包含野生型DNA聚合酶的文库定量试剂盒仅能定量“容易(easy)”的文库分子
KAPA 文库定量试剂盒
KAPA 文库定量试剂盒

qPCR能准确定量所有可测序分子。

(A)文库制备流程中,DNA插入片段和连接接头(adapter)会产生很多连接情况,除了两段皆连接上接头的可以被测序的文库文字,有一些连接情况(虚线框内)不支持后续的成簇扩增,不能被测序。qPCR能仅检测接头连接正确的分子,这对于PCR-free工作流程是特别关键的。分光光度法、荧光法及电泳法会检测所有的双链分子,无论接头的连接情况。(B)过度的文库扩增会导致引物消耗,随后的变性及退火过程会产生不完全退火的部分双链、部分单链的DNA异构体。采用dsDNA结合染料的电泳和荧光检测仅能检测完整的双链DNA片段,导致对过度扩增文库定量的低估。

产品质量可靠,一致性高

  • KAPA SYBR FAST的性能使单套DNA标准品适用于所有类型的NGS文库
  • 预稀释的标准品生产拥有极高的批次间一致性
KAPA 文库定量试剂盒
KAPA 文库定量试剂盒

在不同NGS文库类型及多批次产品间的高度一致性。

(A)用不同批次(批次1和2)及同一批次不同组(第1和第2组)的KAPA Illumina®平台文库构建试剂盒,定量9个人类WGS文库(41% GC)和两个微生物WGS文库(红球菌属物种,70% GC和葡萄球菌属物种,35% GC)。(B)自2009年9月以来发布的56个连续批次的KAPA DNA标准品的扩增效率。

多重(Multiplex) 测序: 不同质量的样本,也可得到可重复的成簇密度

  • KAPA文库定量,能够实现可预测的成簇密度,从而最大化利用测序仪的测序能力和测序通量
  • 不论文库混合前的浓度,经过准确、灵敏地定量,能实现标签序列标记的文库,等摩尔混合,再上机测序
  • 文库混合池(library pool) 中的不同文库的测序reads均一分布,优化测序成本
  • 所有文库类型均可获得可靠结果,包括从低质量FFPE DNA样本制备的文库
KAPA 文库定量试剂盒

准确、可重复的文库定量能使成簇密度达到高度一致。

在Broad研究所(Cambridge, MA, USA),在Illumina® GA测序工作流程中应用KAPA文库定量试剂盒显著降低了簇密度的差异性,并消除了滴定的需求。此处展示了连续文库每个tile中簇的平均数目。

KAPA 文库定量试剂盒
KAPA 文库定量试剂盒

准确和灵敏的定量能使多重测序库中Reads均匀分布。

使用用于Illumina平台的KAPA文库定量试剂盒,通过qPCR来定量从高质量人类基因组DNA(深色条)或FFPE DNA(浅色条)制备的24个有标签序列的文库,并组合成为三个等摩尔浓度的测序池。在HiSeq 2500测序仪相同flow cell的不同泳道中对每个测序池进行测序。(A)24个不同文库(标号1~24)代表了约44倍范围的预混合浓度(5.2nM至229.8nM),而测序read分布(B)仅在9.6%至13.9%之间变化。在泳道1、2、3中用于测序的预混合文库浓度的变异系数(CV)分别为94.9%、49.4%和127.9%。KAPA文库定量试剂盒能够进行准确的等摩尔混合,在标准化后CV降低至2.5%、4.8%和11.2%。

MC-CN-00364 有效期至2021-12-31

仅供研究,不用于临床诊断。

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相关应用

  • Quantification of libraries prior to pooling for multiplexed sequencing
  • Quantification of libraries prior to and after hybridization capture
  • Quantification of individual libraries or library pools prior to cluster amplification or emPCR
  • Quality control, optimization and troubleshooting of library construction processes or workflows

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产品手册

SEQ100005_Kapa_LibQuant_SS_单页

规格明细 / 储存条件

Kits can be stored for up to 12 months at -20˚C.

Complete kits include KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix (2X), Primer Premix (10X) and a set of 6 DNA Standards. Reagents for qPCR (KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix and Primer Premix) and DNA Standards (1–6) are also sold separately. Where noted, Master Mixes contain instrument-specific reference dyes, while the Universal kit includes ROX High and ROX Low (both 50X) separately.

Components–Illumina® Platform

KAPA 文库定量试剂盒

Components–Illumina® Platform

KAPA 文库定量试剂盒

规格明细

规格 描述
Compatible Platform Illumina HiSeq, NextSeq, MiSeq, and GAIIx Ion Torrent Proton and PGM 454 GS FLX+ and GS Junior SOLiD 5500 series
Library Type Any
Starting Material Any NGS library ready for cluster amplification or emPCR
Standard curve
concentration range
20–0.0002 pM for Illumina libraries 83–0.00083 pM for Ion Torrent and 454 libraries 10–0.0001 pg/µL for SOLiD libraries
Sequencing
Applications
Whole Genome Sequencing Whole Exome Sequencing Targeted Sequencing (custom panels) RNA-Seq ChIP-Seq Amplicon Sequencing Methyl-Seq

订货信息

KAPA 文库定量试剂盒,Illumina 平台(通用)

  • KK货号:KK4824
  • 产品货号:07960140001
  • 适用的qPCR仪器:通用

KAPA 文库定量试剂盒,Illumina 平台(ABI Prism®)

  • KK货号:KK4835
  • 产品货号:07960204001
  • 适用的qPCR仪器:ABI Prism®

KAPA 文库定量试剂盒,Illumina 平台(Bio-Rad iCycler™)

  • KK货号:KK4844
  • 产品货号:07960255001
  • 适用的qPCR仪器:Bio-Rad iCycler™

KAPA 文库定量试剂盒,Illumina 平台(Roche LightCycler® 480)

  • KK货号:KK4854
  • 产品货号:07960298001
  • 适用的qPCR仪器:Roche LightCycler® 480

KAPA 文库定量试剂盒,Illumina 平台(ROX Low)

  • KK货号:KK4873
  • 产品货号:07960336001
  • 适用的qPCR仪器:ROX Low

KAPA 文库定量试剂盒,Ion Torrent PGM 平台(通用)

  • KK货号:KK4827
  • 产品货号:07960158001
  • 适用的qPCR仪器:通用

KAPA 文库定量试剂盒,Ion Torrent PGM 平台(ABI Prism®)

  • KK货号:KK4838
  • 产品货号:07960212001
  • 适用的qPCR仪器:ABI Prism®

KAPA 文库定量试剂盒,Ion Torrent PGM 平台(Bio-Rad iCycler™)

  • KK货号:KK4847
  • 产品货号:07960263001
  • 适用的qPCR仪器:Bio-Rad iCycler™

KAPA 文库定量试剂盒,Ion Torrent PGM 平台(Roche LightCycler® 480)

  • KK货号:KK4857
  • 产品货号:07960301001
  • 适用的qPCR仪器:Roche LightCycler® 480

KAPA 文库定量试剂盒,Ion Torrent PGM 平台(ROX Low)

  • KK货号:KK4874
  • 产品货号:07960344001
  • 适用的qPCR仪器:ROX Lows

*所有试剂盒均包含5ml KAPA SYBR ®FAST qPCR Master Mix (2X), 1ml Primer Premix, 和 6 X 80 uL DNA 定量标准品. 按产品标识注明,试剂盒内包含的引物、DNA定量标准品和qPCR试剂是针对不同DNA测序平台和qPCR仪器进行配制的。引物预混液和DNA定量标准品也可单独购买。

KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

KAPA STRANDED RNA-SEQ试剂盒+mRNA富集模块

KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

基于mRNA富集法的RNA测序可集中研究转录本外显子区域

KAPA Stranded RNA-Seq流程中,在文库制备前使用KAPA mRNA捕获磁珠,可富集成熟mRNA, 去除不含poly(A)尾的RNA(包括核糖体RNA、前体RNA和非编码RNA)。

产品特色

  • 集中测序编码蛋白的转录本
  • 比KAPA Stranded RNA-Seq试剂盒性能更佳
  • 提升富含GC和低丰度转录本区域的覆盖度
  • 可检测更多数量的转录本和基因
  • 通过验证的自动化方案
  • 使用KAPA 接头(Adapters)和KAPA 纯化磁珠(Pure Beads)构建完整文库制备解决方案

KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

获得高测序数据质量

  • 降低测序结果的重复率(duplication rate), 从而提高测序通量
  • 检出更多特异的转录本和特异的基因
  • 在多个转录本之间,保持覆盖度均一性
KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

高灵敏性的检测表达基因。

使用KAPA Stranded mRNA-Seq制备的文库,与 I 系列产品制备同类型文库相比有着更低的重复率,保持了链特异性的同时,更多特异的转录本和特异的基因被检出。

KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

覆盖均一性提升。

500 ng高质量RNA使用KAPA Stranded mRNA-Seq Kit和 I 系列产品进行文库制备,KAPA文库制备试剂盒在5’和3 端’位置测序的均一性更好。

发现难找到的转录本

  • 提升了富含GC区域转录本的覆盖度
  • 检测到更多外显子区域
KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

富含GC转录本的覆盖度得到提升。

DVL3转录本的5’和3’端位置外显子区域(红色)为高GC含量区域。使用KAPA StrandedmRNA-Seq试剂盒(绿色)测序结果与 I 系列产品(橙色)结果相比,绿色区域有着更高的测序覆盖度。

检测低丰度转录本

  • 可检测到其他试剂盒高起始量也无法覆盖的区域
  • 不同起始量的样本,均可保持测序的高度均一性
KAPA Stranded RNAseq 文库构建试剂盒 + mRNA 富集试剂盒

低表达的转录本的覆盖度提升。

使用KAPA Stranded mRNA-Seq试剂盒(绿色)与 I 系列产品(橙色)进行文库制备,KAPA在GLTPD1基因上的覆盖度更高,即使测序深度相同, I 系列产品覆盖度仍有缺失(红色区域)。

MC-CN-00381 有效期至2021-12-31

仅供研究,不用于临床诊断。

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相关应用

  • 全转录组
    Whole transcriptome
  • Transcript Discovery and Annotation
  • Gene Expression
  • Total RNA-Seq

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产品手册

KAPA_Stranded_RNA_Seq_TDS.pdf

规格明细 / 储存条件

Shipping and storage

The enzymes provided in this kit are temperature sensitive, and appropriate care should be taken during shipping and storage. KAPA Stranded RNA-Seq Library Preparation Kits are shipped on dry ice or ice packs, depending on the destination country. Upon receipt, immediately store enzymes and reaction buffers at -20˚C in a constanttemperature freezer. The PEG/NaCl SPRI® Solution should be protected from light, and stored at -20˚C. For shortterm use, the PEG/NaCl SPRI® Solution may be stored protected from light at 4˚C for up to 2 months. When stored under these conditions and handled correctly, the kit components will retain full activity until the expiry date indicated on the kit label.

Handling

Always ensure that components have been fully thawed and thoroughly mixed before use. Keep all reaction components and master mixes on ice whenever possible during handling. KAPA HiFi HotStart ReadyMix (2X) may not freeze completely, even when stored at -20 °C. Nevertheless, always ensure that the KAPA HiFi HotStart ReadyMix is fully thawed and thoroughly mixed before use. PEG/NaCl SPRI® Solution does not freeze at -20 °C, but should be equilibrated to room temperature and mixed thoroughly before use.

Quality control

All kit components are subjected to stringent functional quality control, are free of detectable contaminating exoand endonuclease activities, and meet strict requirements with respect to DNA contamination. Please contact support@kapabiosystems.com for more information.

订货信息

KAPA Stranded RNA-Seq 文库构建试剂盒 (24个反应)

  • KK货号:KK8400
  • 产品货号:07962142001
  • 规格:24反应

KAPA Stranded RNA-Seq 文库构建试剂盒 (96个反应)

  • KK货号:KK8401
  • 产品货号:07962169001
  • 规格:96反应